RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422080.5

HDLBP-208, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 3

Gene HDLBP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HDLBP-208	ENST00000422080	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		6.19	□□□□□ -1.42
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.13	□□□□□ -1.43
HDLBP-208	ENST00000422080	MT4	P47944	62 aa		6.12	□□□□□ -1.43
HDLBP-208	ENST00000422080	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.11	□□□□□ -1.43
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.09	□□□□□ -1.43
HDLBP-208	ENST00000422080	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.07	□□□□□ -1.44
HDLBP-208	ENST00000422080	UQCR11	O14957	56 aa		6.07	□□□□□ -1.44
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.07	□□□□□ -1.44
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HDLBP-208	ENST00000422080	TMEM258	P61165	79 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.92	□□□□□ -1.46
HDLBP-208	ENST00000422080	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.91	□□□□□ -1.46
HDLBP-208	ENST00000422080	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.9	□□□□□ -1.46
HDLBP-208	ENST00000422080		K7ERS5	55 aa		5.84	□□□□□ -1.47
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.84	□□□□□ -1.47
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-208	ENST00000422080	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
HDLBP-208	ENST00000422080		V9GYY9	64 aa		5.77	□□□□□ -1.49
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-208	ENST00000422080	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.73	□□□□□ -1.49
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.73	□□□□□ -1.49
HDLBP-208	ENST00000422080	PSPHP1	O15172	72 aa		5.71	□□□□□ -1.5
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.7	□□□□□ -1.5
HDLBP-208	ENST00000422080		Q1T7F1	81 aa		5.7	□□□□□ -1.5
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.64	□□□□□ -1.51
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.63	□□□□□ -1.51
HDLBP-208	ENST00000422080	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.57	□□□□□ -1.52
HDLBP-208	ENST00000422080		A6NED7	52 aa		5.52	□□□□□ -1.53
HDLBP-208	ENST00000422080	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.5	□□□□□ -1.53
HDLBP-208	ENST00000422080	ROMO1	P60602	79 aa		5.41	□□□□□ -1.54
HDLBP-208	ENST00000422080	MT1A	P04731	61 aa		5.37	□□□□□ -1.55
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.34	□□□□□ -1.55
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.32	□□□□□ -1.56
HDLBP-208	ENST00000422080	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.28	□□□□□ -1.56
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.27	□□□□□ -1.57
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.24	□□□□□ -1.57
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HDLBP-208	ENST00000422080	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HDLBP-208	ENST00000422080	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HDLBP-208	ENST00000422080	MT3	P25713	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-208	ENST00000422080	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-208	ENST00000422080	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-208	ENST00000422080	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-208	ENST00000422080	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-208	ENST00000422080	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-208	ENST00000422080	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDLBP-208	ENST00000422080	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.47	□□□□□ -1.69
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HDLBP-208	ENST00000422080		H3BS24	57 aa		3.86	□□□□□ -1.79
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.83	□□□□□ -1.8
HDLBP-208	ENST00000422080	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.82	□□□□□ -1.8
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.78	□□□□□ -1.8
HDLBP-208	ENST00000422080	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HDLBP-208	ENST00000422080	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HDLBP-208	ENST00000422080		A0A0A0MQY5	61 aa		3.49	□□□□□ -1.85
HDLBP-208	ENST00000422080	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HDLBP-208	ENST00000422080	INE1	O15225	51 aa		3.22	□□□□□ -1.89
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.21	□□□□□ -1.9
HDLBP-208	ENST00000422080	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.05	□□□□□ -1.92
HDLBP-208	ENST00000422080	PRM1	P04553	51 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HDLBP-208	ENST00000422080	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.6	□□□□□ -1.99
HDLBP-208	ENST00000422080	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.21	□□□□□ -2.06

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