RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1LQ93083 61 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1EP04732 61 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MDN1Q9NU22 5596 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1GP13640 62 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1MQ8N339 61 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.9□□□□□ -1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-9P26371 169 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2EP22531 72 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2BP35325 72 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2AP35326 72 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP12-4P60329 112 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE3BQ5TA77 95 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2DP22532 72 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 NEBP20929 6669 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1AP04731 61 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PRM1P04553 51 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 MT4P47944 62 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 MT3P25713 68 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1DQ5T752 114 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE4AQ5TA78 99 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.47□□□□□ -1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC5ACP98088 5654 aa4.15□□□□□ -1.74
SH3BP1-202ENST00000417536 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1EQ5T753 118 aa4.07□□□□□ -1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.94□□□□□ -1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-8O75690 187 aa3.86□□□□□ -1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1CQ5T751 118 aa3.72□□□□□ -1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.55□□□□□ -1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.51□□□□□ -1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.38□□□□□ -1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE1FQ5T754 118 aa3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PHGR1C9JFL3 82 aa2.84□□□□□ -1.96
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.84□□□□□ -2.11
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