RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 PCP4P48539 62 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD54-204ENST00000411961 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE4AQ5TA78 99 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE1DQ5T752 114 aa6.78□□□□□ -1.32
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.78□□□□□ -1.32
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP12-3P60328 96 aa6.77□□□□□ -1.33
ANKRD54-204ENST00000411961 K7ERS5 55 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD54-204ENST00000411961 MT4P47944 62 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD54-204ENST00000411961 V9GYY9 64 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 PSPHP1O15172 72 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.63□□□□□ -1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 Q1T7F1 81 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD54-204ENST00000411961 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD54-204ENST00000411961 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD54-204ENST00000411961 A6NED7 52 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD54-204ENST00000411961 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.41□□□□□ -1.38
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.41□□□□□ -1.38
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP12-4P60329 112 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.26□□□□□ -1.41
ANKRD54-204ENST00000411961 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD54-204ENST00000411961 ROMO1P60602 79 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.15□□□□□ -1.42
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.09□□□□□ -1.43
ANKRD54-204ENST00000411961 MT1AP04731 61 aa5.94□□□□□ -1.46
ANKRD54-204ENST00000411961 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.89□□□□□ -1.47
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD54-204ENST00000411961 BRK1Q8WUW1 75 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-8O75690 187 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD54-204ENST00000411961 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD54-204ENST00000411961 MT3P25713 68 aa5.47□□□□□ -1.53
ANKRD54-204ENST00000411961 PMAIP1Q13794 54 aa5.47□□□□□ -1.53
ANKRD54-204ENST00000411961 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
ANKRD54-204ENST00000411961 MUC5ACP98088 5654 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD54-204ENST00000411961 PRO0628Q9UI54 55 aa5.4□□□□□ -1.54
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.3□□□□□ -1.56
ANKRD54-204ENST00000411961 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.27□□□□□ -1.57
ANKRD54-204ENST00000411961 SVIPQ8NHG7 77 aa5.19□□□□□ -1.58
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.18□□□□□ -1.58
ANKRD54-204ENST00000411961 PRAC1Q96KF2 57 aa5.17□□□□□ -1.58
ANKRD54-204ENST00000411961 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.06□□□□□ -1.6
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE1EQ5T753 118 aa4.99□□□□□ -1.61
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.75□□□□□ -1.65
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.68□□□□□ -1.66
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE1CQ5T751 118 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD54-204ENST00000411961 LUZP6Q538Z0 58 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.24□□□□□ -1.73
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.18□□□□□ -1.74
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
ANKRD54-204ENST00000411961 LCE1FQ5T754 118 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD54-204ENST00000411961 NDUFAF8A1L188 74 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD54-204ENST00000411961 PHGR1C9JFL3 82 aa3.71□□□□□ -1.82
ANKRD54-204ENST00000411961 H3BS24 57 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
ANKRD54-204ENST00000411961 A0A0A0MQY5 61 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD54-204ENST00000411961 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD54-204ENST00000411961 INE1O15225 51 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD54-204ENST00000411961 PRM1P04553 51 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD54-204ENST00000411961 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.81□□□□□ -1.96
ANKRD54-204ENST00000411961 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.33□□□□□ -2.04
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