RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

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Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.33□□□□□ -1.72
TMOD1-202ENST00000375175 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.31□□□□□ -1.72
TMOD1-202ENST00000375175 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
TMOD1-202ENST00000375175 MT1GP13640 62 aa4.28□□□□□ -1.72
TMOD1-202ENST00000375175 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.26□□□□□ -1.73
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD1-202ENST00000375175 MT1MQ8N339 61 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD1-202ENST00000375175 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD1-202ENST00000375175 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP12-4P60329 112 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD1-202ENST00000375175 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TMOD1-202ENST00000375175 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD1-202ENST00000375175 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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TMOD1-202ENST00000375175 LCE3BQ5TA77 95 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD1-202ENST00000375175 MT1AP04731 61 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.79□□□□□ -1.8
TMOD1-202ENST00000375175 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
TMOD1-202ENST00000375175 PRM1P04553 51 aa3.77□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR2EP22531 72 aa3.76□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-9P26371 169 aa3.76□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR2BP35325 72 aa3.76□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR2AP35326 72 aa3.76□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.76□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD1-202ENST00000375175 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD1-202ENST00000375175 SPRR2DP22532 72 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD1-202ENST00000375175 NEBP20929 6669 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD1-202ENST00000375175 MT3P25713 68 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD1-202ENST00000375175 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.4□□□□□ -1.86
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.34□□□□□ -1.88
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD1-202ENST00000375175 MT4P47944 62 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1EQ5T753 118 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD1-202ENST00000375175 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.11□□□□□ -1.91
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.1□□□□□ -1.91
TMOD1-202ENST00000375175 LCE4AQ5TA78 99 aa3.08□□□□□ -1.92
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1DQ5T752 114 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD1-202ENST00000375175 MUC5ACP98088 5654 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.87□□□□□ -1.95
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1CQ5T751 118 aa2.63□□□□□ -1.99
TMOD1-202ENST00000375175 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD1-202ENST00000375175 LCE1FQ5T754 118 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-8O75690 187 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD1-202ENST00000375175 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD1-202ENST00000375175 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD1-202ENST00000375175 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD1-202ENST00000375175 PHGR1C9JFL3 82 aa1.95□□□□□ -2.1
TMOD1-202ENST00000375175 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
TMOD1-202ENST00000375175 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.3□□□□□ -2.2
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