RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369123.3

LIN28B-AS1-201, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIN28B-AS1, Length 575 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.18□□□□□ -1.42
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 Q1T7F1 81 aa6.16□□□□□ -1.42
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PP632Q6XCG6 107 aa6.16□□□□□ -1.42
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE1DQ5T752 114 aa6.15□□□□□ -1.42
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE3AQ5TA76 89 aa6.14□□□□□ -1.43
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.13□□□□□ -1.43
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 K7ERS5 55 aa6.11□□□□□ -1.43
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MT1LQ93083 61 aa6.07□□□□□ -1.44
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PSPHP1O15172 72 aa6.04□□□□□ -1.44
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.03□□□□□ -1.44
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MT1MQ8N339 61 aa6.02□□□□□ -1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6□□□□□ -1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE4AQ5TA78 99 aa5.97□□□□□ -1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP12-3P60328 96 aa5.96□□□□□ -1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.9□□□□□ -1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 A6NED7 52 aa5.89□□□□□ -1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.89□□□□□ -1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.86□□□□□ -1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PCP4P48539 62 aa5.85□□□□□ -1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.77□□□□□ -1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.76□□□□□ -1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.76□□□□□ -1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.73□□□□□ -1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ROMO1P60602 79 aa5.66□□□□□ -1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.63□□□□□ -1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MT4P47944 62 aa5.61□□□□□ -1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.56□□□□□ -1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 H3BS24 57 aa5.55□□□□□ -1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.55□□□□□ -1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.5□□□□□ -1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.42□□□□□ -1.54
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP12-4P60329 112 aa5.4□□□□□ -1.54
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.36□□□□□ -1.55
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.28□□□□□ -1.56
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.27□□□□□ -1.57
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.27□□□□□ -1.57
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MT1AP04731 61 aa5.2□□□□□ -1.58
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BRK1Q8WUW1 75 aa5.13□□□□□ -1.59
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.11□□□□□ -1.59
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.1□□□□□ -1.59
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.09□□□□□ -1.59
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.04□□□□□ -1.6
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PMAIP1Q13794 54 aa4.87□□□□□ -1.63
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.84□□□□□ -1.63
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MT3P25713 68 aa4.78□□□□□ -1.64
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-8O75690 187 aa4.7□□□□□ -1.66
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRO0628Q9UI54 55 aa4.59□□□□□ -1.67
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRAC1Q96KF2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.56□□□□□ -1.68
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.47□□□□□ -1.69
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE1EQ5T753 118 aa4.41□□□□□ -1.7
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.37□□□□□ -1.71
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MUC5ACP98088 5654 aa4.34□□□□□ -1.71
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SVIPQ8NHG7 77 aa4.29□□□□□ -1.72
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE1CQ5T751 118 aa4.07□□□□□ -1.76
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.07□□□□□ -1.76
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LUZP6Q538Z0 58 aa4□□□□□ -1.77
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE3DQ9BYE3 92 aa4□□□□□ -1.77
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.92□□□□□ -1.78
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.8□□□□□ -1.8
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LCE1FQ5T754 118 aa3.6□□□□□ -1.83
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.38□□□□□ -1.87
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 A0A0A0MQY5 61 aa3.32□□□□□ -1.88
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.32□□□□□ -1.88
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NDUFAF8A1L188 74 aa3.15□□□□□ -1.91
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PHGR1C9JFL3 82 aa3.14□□□□□ -1.91
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRM1P04553 51 aa2.85□□□□□ -1.95
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.81□□□□□ -1.96
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 INE1O15225 51 aa2.68□□□□□ -1.98
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms