RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.63□□□□□ -1.83
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.62□□□□□ -1.83
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.6□□□□□ -1.83
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSPOA2VEC9 5147 aa3.58□□□□□ -1.84
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.56□□□□□ -1.84
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.53□□□□□ -1.84
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.52□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.52□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1EQ5T753 118 aa3.52□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1LQ93083 61 aa3.51□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1FQ5T754 118 aa3.5□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1EP04732 61 aa3.48□□□□□ -1.85
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.46□□□□□ -1.86
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE4AQ5TA78 99 aa3.46□□□□□ -1.86
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.45□□□□□ -1.86
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1GP13640 62 aa3.42□□□□□ -1.86
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.4□□□□□ -1.87
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRM1P04553 51 aa3.39□□□□□ -1.87
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1DQ5T752 114 aa3.38□□□□□ -1.87
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.33□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.32□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.29□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.29□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1MQ8N339 61 aa3.26□□□□□ -1.89
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE3BQ5TA77 95 aa3.22□□□□□ -1.89
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.21□□□□□ -1.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.17□□□□□ -1.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT3P25713 68 aa3.14□□□□□ -1.91
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDN1Q9NU22 5596 aa3.13□□□□□ -1.91
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.11□□□□□ -1.91
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.11□□□□□ -1.91
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-9P26371 169 aa3.09□□□□□ -1.91
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.05□□□□□ -1.92
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.02□□□□□ -1.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.02□□□□□ -1.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1AP04731 61 aa3□□□□□ -1.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 NEBP20929 6669 aa2.98□□□□□ -1.93
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.91□□□□□ -1.94
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2EP22531 72 aa2.87□□□□□ -1.95
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2BP35325 72 aa2.87□□□□□ -1.95
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2AP35326 72 aa2.87□□□□□ -1.95
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.79□□□□□ -1.96
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.78□□□□□ -1.96
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.78□□□□□ -1.96
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.77□□□□□ -1.97
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2DP22532 72 aa2.76□□□□□ -1.97
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.53□□□□□ -2
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.53□□□□□ -2
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.5□□□□□ -2.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT4P47944 62 aa2.49□□□□□ -2.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.39□□□□□ -2.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.35□□□□□ -2.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC5ACP98088 5654 aa2.35□□□□□ -2.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1CQ5T751 118 aa2.31□□□□□ -2.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.31□□□□□ -2.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.29□□□□□ -2.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.29□□□□□ -2.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.24□□□□□ -2.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.2□□□□□ -2.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.11□□□□□ -2.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.07□□□□□ -2.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-8O75690 187 aa2.02□□□□□ -2.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.99□□□□□ -2.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.9□□□□□ -2.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.64□□□□□ -2.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHGR1C9JFL3 82 aa1.42□□□□□ -2.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
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