RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.41□□□□□ -1.54
CSAG1-201ENST00000361211 PSPHP1O15172 72 aa5.39□□□□□ -1.55
CSAG1-201ENST00000361211 Q1T7F1 81 aa5.38□□□□□ -1.55
CSAG1-201ENST00000361211 V9GYY9 64 aa5.37□□□□□ -1.55
CSAG1-201ENST00000361211 MT1LQ93083 61 aa5.34□□□□□ -1.55
CSAG1-201ENST00000361211 MT1GP13640 62 aa5.33□□□□□ -1.56
CSAG1-201ENST00000361211 LCE1DQ5T752 114 aa5.32□□□□□ -1.56
CSAG1-201ENST00000361211 LCE4AQ5TA78 99 aa5.32□□□□□ -1.56
CSAG1-201ENST00000361211 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CSAG1-201ENST00000361211 MT1MQ8N339 61 aa5.29□□□□□ -1.56
CSAG1-201ENST00000361211 PP632Q6XCG6 107 aa5.26□□□□□ -1.57
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.25□□□□□ -1.57
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.25□□□□□ -1.57
CSAG1-201ENST00000361211 K7ERS5 55 aa5.24□□□□□ -1.57
CSAG1-201ENST00000361211 PCP4P48539 62 aa5.23□□□□□ -1.57
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP12-3P60328 96 aa5.21□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.2□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 A6NED7 52 aa5.19□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.19□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.17□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.04□□□□□ -1.6
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP23-1A1A580 65 aa5□□□□□ -1.61
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5□□□□□ -1.61
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5□□□□□ -1.61
CSAG1-201ENST00000361211 MT4P47944 62 aa4.97□□□□□ -1.61
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.96□□□□□ -1.62
CSAG1-201ENST00000361211 ROMO1P60602 79 aa4.95□□□□□ -1.62
CSAG1-201ENST00000361211 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.93□□□□□ -1.62
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.9□□□□□ -1.63
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSAG1-201ENST00000361211 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.83□□□□□ -1.64
CSAG1-201ENST00000361211 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.8□□□□□ -1.64
CSAG1-201ENST00000361211 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.73□□□□□ -1.65
CSAG1-201ENST00000361211 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.68□□□□□ -1.66
CSAG1-201ENST00000361211 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.63□□□□□ -1.67
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP12-4P60329 112 aa4.63□□□□□ -1.67
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.59□□□□□ -1.67
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.59□□□□□ -1.67
CSAG1-201ENST00000361211 BRK1Q8WUW1 75 aa4.58□□□□□ -1.68
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
CSAG1-201ENST00000361211 MT1AP04731 61 aa4.53□□□□□ -1.68
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.52□□□□□ -1.69
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.37□□□□□ -1.71
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.37□□□□□ -1.71
CSAG1-201ENST00000361211 PMAIP1Q13794 54 aa4.28□□□□□ -1.72
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.28□□□□□ -1.72
CSAG1-201ENST00000361211 PRAC1Q96KF2 57 aa4.18□□□□□ -1.74
CSAG1-201ENST00000361211 MT3P25713 68 aa4.12□□□□□ -1.75
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-8O75690 187 aa4.1□□□□□ -1.75
CSAG1-201ENST00000361211 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.04□□□□□ -1.76
CSAG1-201ENST00000361211 PRO0628Q9UI54 55 aa4.03□□□□□ -1.76
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.91□□□□□ -1.78
CSAG1-201ENST00000361211 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
CSAG1-201ENST00000361211 MUC5ACP98088 5654 aa3.87□□□□□ -1.79
CSAG1-201ENST00000361211 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.86□□□□□ -1.79
CSAG1-201ENST00000361211 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CSAG1-201ENST00000361211 LCE1EQ5T753 118 aa3.73□□□□□ -1.81
CSAG1-201ENST00000361211 SVIPQ8NHG7 77 aa3.7□□□□□ -1.82
CSAG1-201ENST00000361211 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CSAG1-201ENST00000361211 LCE1CQ5T751 118 aa3.48□□□□□ -1.85
CSAG1-201ENST00000361211 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.47□□□□□ -1.85
CSAG1-201ENST00000361211 LUZP6Q538Z0 58 aa3.42□□□□□ -1.86
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.39□□□□□ -1.87
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CSAG1-201ENST00000361211 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0A0MQY5 61 aa3.17□□□□□ -1.9
CSAG1-201ENST00000361211 LCE1FQ5T754 118 aa3.03□□□□□ -1.92
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.97□□□□□ -1.93
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFAF8A1L188 74 aa2.86□□□□□ -1.95
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.79□□□□□ -1.96
CSAG1-201ENST00000361211 PHGR1C9JFL3 82 aa2.72□□□□□ -1.97
CSAG1-201ENST00000361211 PRM1P04553 51 aa2.56□□□□□ -2
CSAG1-201ENST00000361211 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
CSAG1-201ENST00000361211 INE1O15225 51 aa2.25□□□□□ -2.05
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2□□□□□ -2.09
CSAG1-201ENST00000361211 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms