RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.15□□□□□ -1.43
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTB-201ENST00000331789 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.1□□□□□ -1.43
ACTB-201ENST00000331789 MT1GP13640 62 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-201ENST00000331789 MT1MQ8N339 61 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-201ENST00000331789 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ACTB-201ENST00000331789 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-9P26371 169 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-201ENST00000331789 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-201ENST00000331789 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.84□□□□□ -1.47
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2EP22531 72 aa5.77□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2BP35325 72 aa5.77□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2AP35326 72 aa5.77□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 A0A0A0MQY5 61 aa5.76□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.74□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 MDN1Q9NU22 5596 aa5.74□□□□□ -1.49
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.68□□□□□ -1.5
ACTB-201ENST00000331789 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ACTB-201ENST00000331789 SPRR2DP22532 72 aa5.54□□□□□ -1.52
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
ACTB-201ENST00000331789 NEBP20929 6669 aa5.39□□□□□ -1.55
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.36□□□□□ -1.55
ACTB-201ENST00000331789 MT1AP04731 61 aa5.35□□□□□ -1.55
ACTB-201ENST00000331789 INE1O15225 51 aa5.31□□□□□ -1.56
ACTB-201ENST00000331789 LCE3BQ5TA77 95 aa5.31□□□□□ -1.56
ACTB-201ENST00000331789 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.12□□□□□ -1.59
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.09□□□□□ -1.6
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.07□□□□□ -1.6
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.03□□□□□ -1.6
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP12-4P60329 112 aa4.93□□□□□ -1.62
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.9□□□□□ -1.62
ACTB-201ENST00000331789 MT4P47944 62 aa4.85□□□□□ -1.63
ACTB-201ENST00000331789 LCE4AQ5TA78 99 aa4.85□□□□□ -1.63
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.85□□□□□ -1.63
ACTB-201ENST00000331789 MT3P25713 68 aa4.83□□□□□ -1.64
ACTB-201ENST00000331789 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.82□□□□□ -1.64
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.72□□□□□ -1.65
ACTB-201ENST00000331789 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.71□□□□□ -1.66
ACTB-201ENST00000331789 LCE1DQ5T752 114 aa4.7□□□□□ -1.66
ACTB-201ENST00000331789 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.6□□□□□ -1.67
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.6□□□□□ -1.67
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
ACTB-201ENST00000331789 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.44□□□□□ -1.7
ACTB-201ENST00000331789 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.34□□□□□ -1.72
ACTB-201ENST00000331789 PRM1P04553 51 aa4.25□□□□□ -1.73
ACTB-201ENST00000331789 LCE1EQ5T753 118 aa4.09□□□□□ -1.75
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.03□□□□□ -1.76
ACTB-201ENST00000331789 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.03□□□□□ -1.76
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.98□□□□□ -1.77
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.97□□□□□ -1.77
ACTB-201ENST00000331789 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.96□□□□□ -1.78
ACTB-201ENST00000331789 MUC5ACP98088 5654 aa3.92□□□□□ -1.78
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-8O75690 187 aa3.88□□□□□ -1.79
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.88□□□□□ -1.79
ACTB-201ENST00000331789 LCE1CQ5T751 118 aa3.84□□□□□ -1.79
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.77□□□□□ -1.81
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.62□□□□□ -1.83
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.54□□□□□ -1.84
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.49□□□□□ -1.85
ACTB-201ENST00000331789 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.36□□□□□ -1.87
ACTB-201ENST00000331789 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.17□□□□□ -1.9
ACTB-201ENST00000331789 LCE1FQ5T754 118 aa2.93□□□□□ -1.94
ACTB-201ENST00000331789 PHGR1C9JFL3 82 aa2.9□□□□□ -1.95
ACTB-201ENST00000331789 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.63□□□□□ -1.99
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
ACTB-201ENST00000331789 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.9□□□□□ -2.1
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