RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.38□□□□□ -1.23
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.38□□□□□ -1.23
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.38□□□□□ -1.23
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.37□□□□□ -1.23
MESP1-201ENST00000300057 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MESP1-201ENST00000300057 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.27□□□□□ -1.25
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.21□□□□□ -1.26
MESP1-201ENST00000300057 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.2□□□□□ -1.26
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.16□□□□□ -1.26
MESP1-201ENST00000300057 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MESP1-201ENST00000300057 MT1GP13640 62 aa7.14□□□□□ -1.27
MESP1-201ENST00000300057 MT1MQ8N339 61 aa7.14□□□□□ -1.27
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.1□□□□□ -1.27
MESP1-201ENST00000300057 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.02□□□□□ -1.29
MESP1-201ENST00000300057 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.01□□□□□ -1.29
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MESP1-201ENST00000300057 MDN1Q9NU22 5596 aa6.85□□□□□ -1.31
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-9P26371 169 aa6.83□□□□□ -1.32
MESP1-201ENST00000300057 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MESP1-201ENST00000300057 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.76□□□□□ -1.33
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MESP1-201ENST00000300057 SPRR2AP35326 72 aa6.69□□□□□ -1.34
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP12-4P60329 112 aa6.66□□□□□ -1.34
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.64□□□□□ -1.35
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.52□□□□□ -1.37
MESP1-201ENST00000300057 SPRR2DP22532 72 aa6.42□□□□□ -1.38
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.38□□□□□ -1.39
MESP1-201ENST00000300057 LCE3BQ5TA77 95 aa6.37□□□□□ -1.39
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MESP1-201ENST00000300057 MT1AP04731 61 aa6.35□□□□□ -1.39
MESP1-201ENST00000300057 NEBP20929 6669 aa6.28□□□□□ -1.4
MESP1-201ENST00000300057 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.14□□□□□ -1.43
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6□□□□□ -1.45
MESP1-201ENST00000300057 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.98□□□□□ -1.45
MESP1-201ENST00000300057 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.96□□□□□ -1.45
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MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.86□□□□□ -1.47
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.81□□□□□ -1.48
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.81□□□□□ -1.48
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.75□□□□□ -1.49
MESP1-201ENST00000300057 MT3P25713 68 aa5.72□□□□□ -1.49
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.7□□□□□ -1.5
MESP1-201ENST00000300057 MT4P47944 62 aa5.64□□□□□ -1.51
MESP1-201ENST00000300057 LCE4AQ5TA78 99 aa5.57□□□□□ -1.52
MESP1-201ENST00000300057 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.49□□□□□ -1.53
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.48□□□□□ -1.53
MESP1-201ENST00000300057 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.46□□□□□ -1.54
MESP1-201ENST00000300057 LCE1DQ5T752 114 aa5.44□□□□□ -1.54
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.35□□□□□ -1.55
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.22□□□□□ -1.57
MESP1-201ENST00000300057 LCE1EQ5T753 118 aa4.85□□□□□ -1.63
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.85□□□□□ -1.63
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MESP1-201ENST00000300057 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.78□□□□□ -1.64
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MESP1-201ENST00000300057 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.7□□□□□ -1.66
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.64□□□□□ -1.67
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.6□□□□□ -1.67
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.55□□□□□ -1.68
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.54□□□□□ -1.68
MESP1-201ENST00000300057 LCE1CQ5T751 118 aa4.5□□□□□ -1.69
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-8O75690 187 aa4.46□□□□□ -1.7
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.29□□□□□ -1.72
MESP1-201ENST00000300057 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.28□□□□□ -1.72
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.73
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.13□□□□□ -1.75
MESP1-201ENST00000300057 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.92□□□□□ -1.78
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.85□□□□□ -1.79
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.79□□□□□ -1.8
MESP1-201ENST00000300057 LCE1FQ5T754 118 aa3.78□□□□□ -1.8
MESP1-201ENST00000300057 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
MESP1-201ENST00000300057 PHGR1C9JFL3 82 aa3.39□□□□□ -1.87
MESP1-201ENST00000300057 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.36□□□□□ -1.87
MESP1-201ENST00000300057 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.22□□□□□ -2.05
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