RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.62□□□□□ -1.03
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.59□□□□□ -1.03
PKDCC-201ENST00000294964 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKDCC-201ENST00000294964 MT1EP04732 61 aa8.32□□□□□ -1.08
PKDCC-201ENST00000294964 MT1LQ93083 61 aa8.31□□□□□ -1.08
PKDCC-201ENST00000294964 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.17□□□□□ -1.1
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.11□□□□□ -1.11
PKDCC-201ENST00000294964 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.08□□□□□ -1.12
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-9P26371 169 aa8.07□□□□□ -1.12
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.04□□□□□ -1.12
PKDCC-201ENST00000294964 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.04□□□□□ -1.12
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.03□□□□□ -1.12
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.97□□□□□ -1.13
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP12-4P60329 112 aa7.96□□□□□ -1.14
PKDCC-201ENST00000294964 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PKDCC-201ENST00000294964 MDN1Q9NU22 5596 aa7.93□□□□□ -1.14
PKDCC-201ENST00000294964 MT1GP13640 62 aa7.9□□□□□ -1.15
PKDCC-201ENST00000294964 MT1MQ8N339 61 aa7.79□□□□□ -1.16
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.77□□□□□ -1.17
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.77□□□□□ -1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SPRR2EP22531 72 aa7.73□□□□□ -1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SPRR2BP35325 72 aa7.73□□□□□ -1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SPRR2AP35326 72 aa7.73□□□□□ -1.17
PKDCC-201ENST00000294964 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.68□□□□□ -1.18
PKDCC-201ENST00000294964 NEBP20929 6669 aa7.61□□□□□ -1.19
PKDCC-201ENST00000294964 SPRR2DP22532 72 aa7.44□□□□□ -1.22
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.36□□□□□ -1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKDCC-201ENST00000294964 LCE3BQ5TA77 95 aa7.32□□□□□ -1.24
PKDCC-201ENST00000294964 PRM1P04553 51 aa7.17□□□□□ -1.26
PKDCC-201ENST00000294964 MT1AP04731 61 aa7.15□□□□□ -1.26
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.13□□□□□ -1.27
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKDCC-201ENST00000294964 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.07□□□□□ -1.28
PKDCC-201ENST00000294964 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.04□□□□□ -1.28
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.03□□□□□ -1.28
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.9□□□□□ -1.31
PKDCC-201ENST00000294964 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.81□□□□□ -1.32
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.7□□□□□ -1.34
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PKDCC-201ENST00000294964 LCE4AQ5TA78 99 aa6.56□□□□□ -1.36
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.53□□□□□ -1.36
PKDCC-201ENST00000294964 MT4P47944 62 aa6.5□□□□□ -1.37
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.45□□□□□ -1.38
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1DQ5T752 114 aa6.44□□□□□ -1.38
PKDCC-201ENST00000294964 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.41□□□□□ -1.38
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.27□□□□□ -1.41
PKDCC-201ENST00000294964 MT3P25713 68 aa6.21□□□□□ -1.42
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.06□□□□□ -1.44
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1EQ5T753 118 aa6.02□□□□□ -1.45
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.02□□□□□ -1.45
PKDCC-201ENST00000294964 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.76□□□□□ -1.49
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.5□□□□□ -1.53
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.49□□□□□ -1.53
PKDCC-201ENST00000294964 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.39□□□□□ -1.55
PKDCC-201ENST00000294964 MUC5ACP98088 5654 aa5.37□□□□□ -1.55
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-8O75690 187 aa5.31□□□□□ -1.56
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.26□□□□□ -1.57
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.23□□□□□ -1.57
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.11□□□□□ -1.59
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.98□□□□□ -1.61
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1CQ5T751 118 aa4.92□□□□□ -1.62
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.79□□□□□ -1.64
PKDCC-201ENST00000294964 LCE1FQ5T754 118 aa4.71□□□□□ -1.66
PKDCC-201ENST00000294964 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.56□□□□□ -1.68
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.55□□□□□ -1.68
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.4□□□□□ -1.71
PKDCC-201ENST00000294964 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.38□□□□□ -1.71
PKDCC-201ENST00000294964 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.36□□□□□ -1.71
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.25□□□□□ -1.73
PKDCC-201ENST00000294964 PHGR1C9JFL3 82 aa3.77□□□□□ -1.81
PKDCC-201ENST00000294964 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.4□□□□□ -2.02
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