RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.61□□□□□ -1.19
C6orf136-201ENST00000293604 MT1LQ93083 61 aa7.59□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.53□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.53□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.53□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf136-201ENST00000293604 MT1GP13640 62 aa7.29□□□□□ -1.24
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.26□□□□□ -1.25
C6orf136-201ENST00000293604 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.26□□□□□ -1.25
C6orf136-201ENST00000293604 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.22□□□□□ -1.25
C6orf136-201ENST00000293604 MT1MQ8N339 61 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf136-201ENST00000293604 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.14□□□□□ -1.27
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.11□□□□□ -1.27
C6orf136-201ENST00000293604 MDN1Q9NU22 5596 aa7.11□□□□□ -1.27
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-9P26371 169 aa7.08□□□□□ -1.28
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.04□□□□□ -1.28
C6orf136-201ENST00000293604 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.9□□□□□ -1.3
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.89□□□□□ -1.31
C6orf136-201ENST00000293604 NEBP20929 6669 aa6.83□□□□□ -1.32
C6orf136-201ENST00000293604 SPRR2EP22531 72 aa6.78□□□□□ -1.32
C6orf136-201ENST00000293604 SPRR2BP35325 72 aa6.78□□□□□ -1.32
C6orf136-201ENST00000293604 SPRR2AP35326 72 aa6.78□□□□□ -1.32
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP12-4P60329 112 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf136-201ENST00000293604 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf136-201ENST00000293604 SPRR2DP22532 72 aa6.53□□□□□ -1.36
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf136-201ENST00000293604 MT1AP04731 61 aa6.46□□□□□ -1.38
C6orf136-201ENST00000293604 LCE3BQ5TA77 95 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.2□□□□□ -1.42
C6orf136-201ENST00000293604 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf136-201ENST00000293604 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.09□□□□□ -1.43
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6□□□□□ -1.45
C6orf136-201ENST00000293604 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C6orf136-201ENST00000293604 MT3P25713 68 aa5.83□□□□□ -1.48
C6orf136-201ENST00000293604 PRM1P04553 51 aa5.82□□□□□ -1.48
C6orf136-201ENST00000293604 LCE4AQ5TA78 99 aa5.82□□□□□ -1.48
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf136-201ENST00000293604 MT4P47944 62 aa5.74□□□□□ -1.49
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1DQ5T752 114 aa5.71□□□□□ -1.49
C6orf136-201ENST00000293604 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.59□□□□□ -1.51
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.51□□□□□ -1.53
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.37□□□□□ -1.55
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.25□□□□□ -1.57
C6orf136-201ENST00000293604 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.24□□□□□ -1.57
C6orf136-201ENST00000293604 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.21□□□□□ -1.57
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.11□□□□□ -1.59
C6orf136-201ENST00000293604 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.02□□□□□ -1.61
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.01□□□□□ -1.61
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1EQ5T753 118 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.84□□□□□ -1.64
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.71□□□□□ -1.66
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-8O75690 187 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1CQ5T751 118 aa4.65□□□□□ -1.67
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.65□□□□□ -1.67
C6orf136-201ENST00000293604 MUC5ACP98088 5654 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
C6orf136-201ENST00000293604 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.17□□□□□ -1.74
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.07□□□□□ -1.76
C6orf136-201ENST00000293604 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.76□□□□□ -1.81
C6orf136-201ENST00000293604 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.65□□□□□ -1.83
C6orf136-201ENST00000293604 LCE1FQ5T754 118 aa3.59□□□□□ -1.83
C6orf136-201ENST00000293604 PHGR1C9JFL3 82 aa3.49□□□□□ -1.85
C6orf136-201ENST00000293604 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.18□□□□□ -1.9
C6orf136-201ENST00000293604 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms