RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.79□□□□□ -1.48
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.64□□□□□ -1.51
PRCC-201ENST00000271526 MT1GP13640 62 aa5.58□□□□□ -1.52
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.57□□□□□ -1.52
PRCC-201ENST00000271526 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.56□□□□□ -1.52
PRCC-201ENST00000271526 MT1MQ8N339 61 aa5.56□□□□□ -1.52
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.53□□□□□ -1.52
PRCC-201ENST00000271526 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PRCC-201ENST00000271526 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.42□□□□□ -1.54
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP12-4P60329 112 aa5.39□□□□□ -1.55
PRCC-201ENST00000271526 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.38□□□□□ -1.55
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PRCC-201ENST00000271526 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.26□□□□□ -1.57
PRCC-201ENST00000271526 MT1AP04731 61 aa5.17□□□□□ -1.58
PRCC-201ENST00000271526 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PRCC-201ENST00000271526 LCE3BQ5TA77 95 aa5.14□□□□□ -1.59
PRCC-201ENST00000271526 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-9P26371 169 aa5.06□□□□□ -1.6
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.06□□□□□ -1.6
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PRCC-201ENST00000271526 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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PRCC-201ENST00000271526 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.93□□□□□ -1.62
PRCC-201ENST00000271526 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PRCC-201ENST00000271526 MDN1Q9NU22 5596 aa4.83□□□□□ -1.64
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.83□□□□□ -1.64
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PRCC-201ENST00000271526 SPRR2EP22531 72 aa4.8□□□□□ -1.64
PRCC-201ENST00000271526 SPRR2BP35325 72 aa4.8□□□□□ -1.64
PRCC-201ENST00000271526 SPRR2AP35326 72 aa4.8□□□□□ -1.64
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PRCC-201ENST00000271526 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.61□□□□□ -1.67
PRCC-201ENST00000271526 SPRR2DP22532 72 aa4.6□□□□□ -1.67
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PRCC-201ENST00000271526 MT3P25713 68 aa4.51□□□□□ -1.69
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.42□□□□□ -1.7
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.29□□□□□ -1.72
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.2□□□□□ -1.74
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.13□□□□□ -1.75
PRCC-201ENST00000271526 LCE4AQ5TA78 99 aa4.11□□□□□ -1.75
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.1□□□□□ -1.75
PRCC-201ENST00000271526 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.1□□□□□ -1.75
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.07□□□□□ -1.76
PRCC-201ENST00000271526 MT4P47944 62 aa3.98□□□□□ -1.77
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.93□□□□□ -1.78
PRCC-201ENST00000271526 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.85□□□□□ -1.79
PRCC-201ENST00000271526 LCE1DQ5T752 114 aa3.84□□□□□ -1.79
PRCC-201ENST00000271526 LCE1EQ5T753 118 aa3.77□□□□□ -1.81
PRCC-201ENST00000271526 MUC5ACP98088 5654 aa3.76□□□□□ -1.81
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PRCC-201ENST00000271526 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.63□□□□□ -1.83
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.6□□□□□ -1.83
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.57□□□□□ -1.84
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.55□□□□□ -1.84
PRCC-201ENST00000271526 LCE1CQ5T751 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PRCC-201ENST00000271526 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.52□□□□□ -1.85
PRCC-201ENST00000271526 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.46□□□□□ -1.86
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PRCC-201ENST00000271526 LCE1FQ5T754 118 aa3.39□□□□□ -1.87
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.3□□□□□ -1.88
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.29□□□□□ -1.88
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-8O75690 187 aa3.28□□□□□ -1.88
PRCC-201ENST00000271526 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.25□□□□□ -1.89
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.11□□□□□ -1.91
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.05□□□□□ -1.92
PRCC-201ENST00000271526 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.87□□□□□ -1.95
PRCC-201ENST00000271526 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PRCC-201ENST00000271526 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.69□□□□□ -1.98
PRCC-201ENST00000271526 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PRCC-201ENST00000271526 PHGR1C9JFL3 82 aa2.62□□□□□ -1.99
PRCC-201ENST00000271526 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms