RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.71□□□□□ -1.5
FCHO1-201ENST00000252771 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.68□□□□□ -1.5
FCHO1-201ENST00000252771 MT1MQ8N339 61 aa5.68□□□□□ -1.5
FCHO1-201ENST00000252771 MT1GP13640 62 aa5.68□□□□□ -1.5
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FCHO1-201ENST00000252771 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
FCHO1-201ENST00000252771 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.61□□□□□ -1.51
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.09□□□□□ -1.59
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FCHO1-201ENST00000252771 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.29□□□□□ -1.72
FCHO1-201ENST00000252771 LCE1DQ5T752 114 aa4.29□□□□□ -1.72
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.2□□□□□ -1.74
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FCHO1-201ENST00000252771 LCE1EQ5T753 118 aa3.82□□□□□ -1.8
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.69□□□□□ -1.82
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.64□□□□□ -1.83
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP5-8O75690 187 aa3.56□□□□□ -1.84
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.46□□□□□ -1.86
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.32□□□□□ -1.88
FCHO1-201ENST00000252771 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.05□□□□□ -1.92
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3□□□□□ -1.93
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.99□□□□□ -1.93
FCHO1-201ENST00000252771 PHGR1C9JFL3 82 aa2.71□□□□□ -1.98
FCHO1-201ENST00000252771 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.67□□□□□ -1.98
FCHO1-201ENST00000252771 LCE1FQ5T754 118 aa2.66□□□□□ -1.98
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.6□□□□□ -1.99
FCHO1-201ENST00000252771 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
FCHO1-201ENST00000252771 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.76□□□□□ -2.13
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