RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640799.1

C1orf43-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C1orf43, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-210ENST00000640799 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.91□□□□□ -1.14
C1orf43-210ENST00000640799 LCE3BQ5TA77 95 aa7.9□□□□□ -1.14
C1orf43-210ENST00000640799 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.88□□□□□ -1.15
C1orf43-210ENST00000640799 ACYP1P07311 99 aa7.86□□□□□ -1.15
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP10-5P60370 271 aa7.86□□□□□ -1.15
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.86□□□□□ -1.15
C1orf43-210ENST00000640799 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.83□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 UQCRQO14949 82 aa7.79□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.79□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 CRIPTQ9P021 101 aa7.79□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 H0Y9P7 68 aa7.78□□□□□ -1.16
C1orf43-210ENST00000640799 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.77□□□□□ -1.17
C1orf43-210ENST00000640799 NEBP20929 6669 aa7.77□□□□□ -1.17
C1orf43-210ENST00000640799 IMUPQ9GZP8 106 aa7.76□□□□□ -1.17
C1orf43-210ENST00000640799 ATOX1O00244 68 aa7.74□□□□□ -1.17
C1orf43-210ENST00000640799 NDUFC1O43677 76 aa7.73□□□□□ -1.17
C1orf43-210ENST00000640799 H0YAA0 97 aa7.71□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 J3QR89 54 aa7.7□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 LINC00643Q86TS7 51 aa7.68□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 A8MUN3 132 aa7.65□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP5-9P26371 169 aa7.65□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 LINC00208Q96KT6 92 aa7.65□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.65□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.65□□□□□ -1.18
C1orf43-210ENST00000640799 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.64□□□□□ -1.19
C1orf43-210ENST00000640799 OCR1Q9BZK8 76 aa7.6□□□□□ -1.19
C1orf43-210ENST00000640799 KMT2DO14686 5537 aa7.59□□□□□ -1.2
C1orf43-210ENST00000640799 MP68P56378 58 aa7.56□□□□□ -1.2
C1orf43-210ENST00000640799 MDN1Q9NU22 5596 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-210ENST00000640799 K7ERU9 68 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-210ENST00000640799 MT1XP80297 61 aa7.5□□□□□ -1.21
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.5□□□□□ -1.21
C1orf43-210ENST00000640799 SVIPQ8NHG7 77 aa7.49□□□□□ -1.21
C1orf43-210ENST00000640799 P0C880 135 aa7.47□□□□□ -1.21
C1orf43-210ENST00000640799 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf43-210ENST00000640799 PLAC4Q8WY50 150 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf43-210ENST00000640799 R4GN34 69 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf43-210ENST00000640799 H3BPC8 53 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf43-210ENST00000640799 DMAC1Q96GE9 116 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf43-210ENST00000640799 MT-ATP8P03928 68 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 M0QZ58 72 aa7.38□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 C20orf197Q8N268 126 aa7.38□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 LCE1DQ5T752 114 aa7.36□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 SCGB1A1P11684 91 aa7.35□□□□□ -1.23
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP12-2P59991 146 aa7.32□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 SPRR2EP22531 72 aa7.31□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 SPRR2BP35325 72 aa7.31□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 SPRR2AP35326 72 aa7.31□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.31□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.29□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 LINC01554Q52M75 96 aa7.29□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.29□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.29□□□□□ -1.24
C1orf43-210ENST00000640799 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.24□□□□□ -1.25
C1orf43-210ENST00000640799 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.22□□□□□ -1.25
C1orf43-210ENST00000640799 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.21□□□□□ -1.26
C1orf43-210ENST00000640799 ACYP2P14621 99 aa7.2□□□□□ -1.26
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.18□□□□□ -1.26
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
C1orf43-210ENST00000640799 H3BS24 57 aa7.13□□□□□ -1.27
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.12□□□□□ -1.27
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP10-12P60413 245 aa7.11□□□□□ -1.27
C1orf43-210ENST00000640799 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.11□□□□□ -1.27
C1orf43-210ENST00000640799 LCE4AQ5TA78 99 aa7.09□□□□□ -1.27
C1orf43-210ENST00000640799 SPRR2DP22532 72 aa7.06□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 SERP2Q8N6R1 65 aa7.06□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.05□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.05□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.05□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 SNURFQ9Y675 71 aa7.03□□□□□ -1.28
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.94□□□□□ -1.3
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.94□□□□□ -1.3
C1orf43-210ENST00000640799 COX7CP15954 63 aa6.93□□□□□ -1.3
C1orf43-210ENST00000640799 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.93□□□□□ -1.3
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.87□□□□□ -1.31
C1orf43-210ENST00000640799 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.83□□□□□ -1.32
C1orf43-210ENST00000640799 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.81□□□□□ -1.32
C1orf43-210ENST00000640799 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.79□□□□□ -1.32
C1orf43-210ENST00000640799 COA5Q86WW8 74 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf43-210ENST00000640799 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf43-210ENST00000640799 H7BZZ5 65 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.72□□□□□ -1.33
C1orf43-210ENST00000640799 A0A0D9SG42 100 aa6.68□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 CCDC179H3BU77 68 aa6.68□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.66□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.66□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 MT1EP04732 61 aa6.65□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 SEC61GP60059 68 aa6.65□□□□□ -1.34
C1orf43-210ENST00000640799 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.61□□□□□ -1.35
C1orf43-210ENST00000640799 A0A1B0GU33 70 aa6.59□□□□□ -1.35
C1orf43-210ENST00000640799 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.59□□□□□ -1.35
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP12-1P59990 96 aa6.56□□□□□ -1.36
C1orf43-210ENST00000640799 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C1orf43-210ENST00000640799 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.51□□□□□ -1.37
C1orf43-210ENST00000640799 TMEM258P61165 79 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-210ENST00000640799 MT1GP13640 62 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms