RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.17□□□□□ -0.94
GLIS1-202ENST00000628545 PKHD1P08F94 4074 aa9.16□□□□□ -0.94
GLIS1-202ENST00000628545 RYR3Q15413 4870 aa9.11□□□□□ -0.95
GLIS1-202ENST00000628545 S4R3F8 94 aa9.08□□□□□ -0.96
GLIS1-202ENST00000628545 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.06□□□□□ -0.96
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.06□□□□□ -0.96
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-1P60331 282 aa9.04□□□□□ -0.96
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP12-2P59991 146 aa9.03□□□□□ -0.96
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.02□□□□□ -0.97
GLIS1-202ENST00000628545 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GLIS1-202ENST00000628545 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GLIS1-202ENST00000628545 XP32Q5T750 250 aa9□□□□□ -0.97
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1B0GVY2 172 aa8.99□□□□□ -0.97
GLIS1-202ENST00000628545 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP12-1P59990 96 aa8.88□□□□□ -0.99
GLIS1-202ENST00000628545 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GLIS1-202ENST00000628545 PLAC4Q8WY50 150 aa8.83□□□□□ -1
GLIS1-202ENST00000628545 FAT1Q14517 4588 aa8.81□□□□□ -1
GLIS1-202ENST00000628545 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GLIS1-202ENST00000628545 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GLIS1-202ENST00000628545 HSPG2P98160 4391 aa8.72□□□□□ -1.01
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-8P60410 259 aa8.68□□□□□ -1.02
GLIS1-202ENST00000628545 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.67□□□□□ -1.02
GLIS1-202ENST00000628545 RYR1P21817 5038 aa8.66□□□□□ -1.02
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.65□□□□□ -1.02
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.57□□□□□ -1.04
GLIS1-202ENST00000628545 M0QZ58 72 aa8.56□□□□□ -1.04
GLIS1-202ENST00000628545 Q5VSD8 79 aa8.53□□□□□ -1.04
GLIS1-202ENST00000628545 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GLIS1-202ENST00000628545 MYCBP2O75592 4640 aa8.43□□□□□ -1.06
GLIS1-202ENST00000628545 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.39□□□□□ -1.07
GLIS1-202ENST00000628545 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.38□□□□□ -1.07
GLIS1-202ENST00000628545 TNXBP22105 4242 aa8.37□□□□□ -1.07
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.34□□□□□ -1.07
GLIS1-202ENST00000628545 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.32□□□□□ -1.08
GLIS1-202ENST00000628545 HERC2O95714 4834 aa8.29□□□□□ -1.08
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.27□□□□□ -1.09
GLIS1-202ENST00000628545 R4GN34 69 aa8.25□□□□□ -1.09
GLIS1-202ENST00000628545 MT1HL1P0DM35 61 aa8.2□□□□□ -1.1
GLIS1-202ENST00000628545 PP632Q6XCG6 107 aa8.2□□□□□ -1.1
GLIS1-202ENST00000628545 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.19□□□□□ -1.1
GLIS1-202ENST00000628545 LPAP08519 4548 aa8.11□□□□□ -1.11
GLIS1-202ENST00000628545 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.07□□□□□ -1.12
GLIS1-202ENST00000628545 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GLIS1-202ENST00000628545 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.02□□□□□ -1.13
GLIS1-202ENST00000628545 J3QL48 77 aa7.95□□□□□ -1.14
GLIS1-202ENST00000628545 LRP2P98164 4655 aa7.87□□□□□ -1.15
GLIS1-202ENST00000628545 HERC1Q15751 4861 aa7.87□□□□□ -1.15
GLIS1-202ENST00000628545 INE1O15225 51 aa7.84□□□□□ -1.16
GLIS1-202ENST00000628545 TNP1P09430 55 aa7.7□□□□□ -1.18
GLIS1-202ENST00000628545 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.69□□□□□ -1.18
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.67□□□□□ -1.18
GLIS1-202ENST00000628545 MUC17Q685J3 4493 aa7.49□□□□□ -1.21
GLIS1-202ENST00000628545 MUC2Q02817 5179 aa7.47□□□□□ -1.21
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.44□□□□□ -1.22
GLIS1-202ENST00000628545 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.4□□□□□ -1.22
GLIS1-202ENST00000628545 RNF213Q63HN8 5207 aa7.29□□□□□ -1.24
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.28□□□□□ -1.24
GLIS1-202ENST00000628545 LCE3AQ5TA76 89 aa7.24□□□□□ -1.25
GLIS1-202ENST00000628545 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GLIS1-202ENST00000628545 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.15□□□□□ -1.26
GLIS1-202ENST00000628545 LCE2CQ5TA81 110 aa7.06□□□□□ -1.28
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.99□□□□□ -1.29
GLIS1-202ENST00000628545 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.91□□□□□ -1.3
GLIS1-202ENST00000628545 MT1HP80294 61 aa6.91□□□□□ -1.3
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-10P60014 251 aa6.9□□□□□ -1.31
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-12P60413 245 aa6.88□□□□□ -1.31
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.88□□□□□ -1.31
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP12-3P60328 96 aa6.83□□□□□ -1.32
GLIS1-202ENST00000628545 M0R2T5 61 aa6.81□□□□□ -1.32
GLIS1-202ENST00000628545 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.65□□□□□ -1.35
GLIS1-202ENST00000628545 MT2AP02795 61 aa6.63□□□□□ -1.35
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-5P60370 271 aa6.61□□□□□ -1.35
GLIS1-202ENST00000628545 MT1FP04733 61 aa6.6□□□□□ -1.35
GLIS1-202ENST00000628545 MT1XP80297 61 aa6.55□□□□□ -1.36
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GLIS1-202ENST00000628545 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.47□□□□□ -1.37
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.46□□□□□ -1.38
GLIS1-202ENST00000628545 MT1BP07438 61 aa6.41□□□□□ -1.38
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.41□□□□□ -1.38
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.39□□□□□ -1.39
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.39□□□□□ -1.39
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.39□□□□□ -1.39
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.35□□□□□ -1.39
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.32□□□□□ -1.4
GLIS1-202ENST00000628545 LCE2BO14633 110 aa6.26□□□□□ -1.41
GLIS1-202ENST00000628545 USH2AO75445 5202 aa6.21□□□□□ -1.41
GLIS1-202ENST00000628545 KMT2DO14686 5537 aa6.14□□□□□ -1.43
GLIS1-202ENST00000628545 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.12□□□□□ -1.43
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.04□□□□□ -1.44
GLIS1-202ENST00000628545 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GLIS1-202ENST00000628545 SSPOA2VEC9 5147 aa6.01□□□□□ -1.45
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.93□□□□□ -1.46
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.93□□□□□ -1.46
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.89□□□□□ -1.47
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP12-4P60329 112 aa5.88□□□□□ -1.47
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.84□□□□□ -1.47
GLIS1-202ENST00000628545 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms