RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 PKHD1P08F94 4074 aa8.1□□□□□ -1.11
PDE4C-211ENST00000597360 S4R3F8 94 aa8.07□□□□□ -1.12
PDE4C-211ENST00000597360 RYR3Q15413 4870 aa8.06□□□□□ -1.12
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4C-211ENST00000597360 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1B0GVY2 172 aa7.96□□□□□ -1.14
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP12-2P59991 146 aa7.96□□□□□ -1.14
PDE4C-211ENST00000597360 LUZP6Q538Z0 58 aa7.96□□□□□ -1.14
PDE4C-211ENST00000597360 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PDE4C-211ENST00000597360 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.87□□□□□ -1.15
PDE4C-211ENST00000597360 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4C-211ENST00000597360 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.8□□□□□ -1.16
PDE4C-211ENST00000597360 FAT1Q14517 4588 aa7.8□□□□□ -1.16
PDE4C-211ENST00000597360 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP12-1P59990 96 aa7.78□□□□□ -1.16
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-8P60410 259 aa7.77□□□□□ -1.17
PDE4C-211ENST00000597360 M0QZ58 72 aa7.73□□□□□ -1.17
PDE4C-211ENST00000597360 PLAC4Q8WY50 150 aa7.72□□□□□ -1.17
PDE4C-211ENST00000597360 HSPG2P98160 4391 aa7.69□□□□□ -1.18
PDE4C-211ENST00000597360 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.68□□□□□ -1.18
PDE4C-211ENST00000597360 R4GN34 69 aa7.67□□□□□ -1.18
PDE4C-211ENST00000597360 RYR1P21817 5038 aa7.66□□□□□ -1.18
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PDE4C-211ENST00000597360 XP32Q5T750 250 aa7.64□□□□□ -1.19
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.64□□□□□ -1.19
PDE4C-211ENST00000597360 MYCBP2O75592 4640 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4C-211ENST00000597360 Q5VSD8 79 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4C-211ENST00000597360 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4C-211ENST00000597360 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4C-211ENST00000597360 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4C-211ENST00000597360 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4C-211ENST00000597360 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4C-211ENST00000597360 TNXBP22105 4242 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4C-211ENST00000597360 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4C-211ENST00000597360 HERC2O95714 4834 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4C-211ENST00000597360 MT1HL1P0DM35 61 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4C-211ENST00000597360 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4C-211ENST00000597360 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4C-211ENST00000597360 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-211ENST00000597360 PP632Q6XCG6 107 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4C-211ENST00000597360 LRP2P98164 4655 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4C-211ENST00000597360 J3QL48 77 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4C-211ENST00000597360 TNP1P09430 55 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE4C-211ENST00000597360 LPAP08519 4548 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4C-211ENST00000597360 HERC1Q15751 4861 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4C-211ENST00000597360 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4C-211ENST00000597360 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4C-211ENST00000597360 MUC2Q02817 5179 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4C-211ENST00000597360 MUC17Q685J3 4493 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4C-211ENST00000597360 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4C-211ENST00000597360 M0R2T5 61 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4C-211ENST00000597360 RNF213Q63HN8 5207 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4C-211ENST00000597360 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4C-211ENST00000597360 LCE3AQ5TA76 89 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4C-211ENST00000597360 INE1O15225 51 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4C-211ENST00000597360 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4C-211ENST00000597360 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4C-211ENST00000597360 LCE2CQ5TA81 110 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-10P60014 251 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP12-3P60328 96 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4C-211ENST00000597360 MT1HP80294 61 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-12P60413 245 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4C-211ENST00000597360 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4C-211ENST00000597360 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4C-211ENST00000597360 MT2AP02795 61 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4C-211ENST00000597360 MT1FP04733 61 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PDE4C-211ENST00000597360 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP10-5P60370 271 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4C-211ENST00000597360 MT1XP80297 61 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4C-211ENST00000597360 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4C-211ENST00000597360 MT1BP07438 61 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4C-211ENST00000597360 USH2AO75445 5202 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4C-211ENST00000597360 KMT2DO14686 5537 aa5.58□□□□□ -1.52
PDE4C-211ENST00000597360 LCE2BO14633 110 aa5.57□□□□□ -1.52
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.53□□□□□ -1.52
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4C-211ENST00000597360 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4C-211ENST00000597360 SSPOA2VEC9 5147 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4C-211ENST00000597360 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.28□□□□□ -1.56
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP12-4P60329 112 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.2□□□□□ -1.58
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