RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.79□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1B0GU33 70 aa5.78□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 NDUFAF8A1L188 74 aa5.78□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 Q5VSD8 79 aa5.75□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.75□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.74□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.73□□□□□ -1.49
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FCHO1-216ENST00000596536 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.61□□□□□ -1.51
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FCHO1-216ENST00000596536 LRP2P98164 4655 aa5.49□□□□□ -1.53
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FCHO1-216ENST00000596536 XP32Q5T750 250 aa5.45□□□□□ -1.54
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FCHO1-216ENST00000596536 S4R3F8 94 aa5.4□□□□□ -1.54
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FCHO1-216ENST00000596536 RNF213Q63HN8 5207 aa5.35□□□□□ -1.55
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FCHO1-216ENST00000596536 M0QZ58 72 aa5.11□□□□□ -1.59
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FCHO1-216ENST00000596536 R4GN34 69 aa5.07□□□□□ -1.6
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.03□□□□□ -1.6
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FCHO1-216ENST00000596536 M0R2T5 61 aa4.93□□□□□ -1.62
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FCHO1-216ENST00000596536 INE1O15225 51 aa4.53□□□□□ -1.68
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.46□□□□□ -1.69
FCHO1-216ENST00000596536 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.44□□□□□ -1.7
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FCHO1-216ENST00000596536 LCE3AQ5TA76 89 aa4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 MT2AP02795 61 aa4.39□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.36□□□□□ -1.71
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-5P60370 271 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.23□□□□□ -1.73
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.19□□□□□ -1.74
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-12P60413 245 aa4.17□□□□□ -1.74
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.97□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-216ENST00000596536 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.82□□□□□ -1.8
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.82□□□□□ -1.8
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.76□□□□□ -1.81
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