RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BT86 120 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 PCP4P48539 62 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-226ENST00000593200 IMUPQ9GZP8 106 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CRIPTQ9P021 101 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 BATFQ16520 125 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPM0 123 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 UBL5Q9BZL1 73 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TAX1BP3O14907 124 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2EP22531 72 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2BP35325 72 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2AP35326 72 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WVE0 104 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 H0YAA0 97 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1XP80297 61 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1DQ5T752 114 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MUN3 132 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 K7ERU9 68 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFC1O43677 76 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PRO0461Q9UI25 63 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EP34 96 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP12-2P59991 146 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PLAC4Q8WY50 150 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB1A1P11684 91 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2DP22532 72 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ACYP1P07311 99 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 H0Y9P7 68 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 ATOX1O00244 68 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 R4GN34 69 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 UQCRQO14949 82 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 J3QR89 54 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 P0C880 135 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 ETDBQ3ZM63 59 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-226ENST00000593200 M0QZ58 72 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 F8W1H4 67 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf197Q8N268 126 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-12P60413 245 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00208Q96KT6 92 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01554Q52M75 96 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.05□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 MT-ATP8P03928 68 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 MP68P56378 58 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-226ENST00000593200 DMAC1Q96GE9 116 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-226ENST00000593200 OCR1Q9BZK8 76 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00643Q86TS7 51 aa3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BPC8 53 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC179H3BU77 68 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-226ENST00000593200 ACYP2P14621 99 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-226ENST00000593200 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1EP04732 61 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-226ENST00000593200 COX7CP15954 63 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM258P61165 79 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0A0MQY5 61 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1GP13640 62 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 SERP2Q8N6R1 65 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 MT4P47944 62 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 PP632Q6XCG6 107 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0D9SG42 100 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms