RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCA10	Q71F78	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576		A6NN06	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576		A6NED7	52 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BPC8	53 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	HRES1	P13985	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	COA5	Q86WW8	74 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BS24	57 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.59	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACYP2	P14621	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT1H	P80294	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GU69	56 aa		4.49	□□□□□ -1.69
EFTUD2-223	ENST00000592576		S4R3F8	94 aa		4.47	□□□□□ -1.69
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0R2T5	61 aa		4.45	□□□□□ -1.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.4	□□□□□ -1.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.39	□□□□□ -1.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	UQCR11	O14957	56 aa		4.39	□□□□□ -1.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.72
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.31	□□□□□ -1.72
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT2A	P02795	61 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YAA0	97 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT1F	P04733	61 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ROMO1	P60602	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-223	ENST00000592576		P0C880	135 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7ERS5	55 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GU33	70 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-223	ENST00000592576		R4GN34	69 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0D9SG42	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0QZ58	72 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCE2B	O14633	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	USH2A	O75445	5202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4	□□□□□ -1.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT1B	P07438	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0A0MQY5	61 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.9	□□□□□ -1.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT1X	P80297	61 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.79	□□□□□ -1.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.71	□□□□□ -1.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
EFTUD2-223	ENST00000592576	KMT2D	O14686	5537 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFTUD2-223	ENST00000592576	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNP1	P09430	55 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.62	□□□□□ -1.83
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.51	□□□□□ -1.85
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.51	□□□□□ -1.85
EFTUD2-223	ENST00000592576	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.43	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.42	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms