RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592194.1

PRKAR1A-220, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-220ENST00000592194 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP10-10P60014 251 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-220ENST00000592194 MT-ATP8P03928 68 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-220ENST00000592194 K7ERU9 68 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 C4orf26Q17RF5 130 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 UQCRQO14949 82 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 OCR1Q9BZK8 76 aa6.59□□□□□ -1.35
PRKAR1A-220ENST00000592194 H0Y9P7 68 aa6.58□□□□□ -1.36
PRKAR1A-220ENST00000592194 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.57□□□□□ -1.36
PRKAR1A-220ENST00000592194 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.55□□□□□ -1.36
PRKAR1A-220ENST00000592194 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 IMUPQ9GZP8 106 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC00208Q96KT6 92 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 ATOX1O00244 68 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 SCGB1A1P11684 91 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 KLKP1Q107X0 134 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-220ENST00000592194 MP68P56378 58 aa6.43□□□□□ -1.38
PRKAR1A-220ENST00000592194 C5orf47Q569G3 176 aa6.42□□□□□ -1.38
PRKAR1A-220ENST00000592194 LCA10Q71F78 164 aa6.39□□□□□ -1.39
PRKAR1A-220ENST00000592194 S4R3F8 94 aa6.39□□□□□ -1.39
PRKAR1A-220ENST00000592194 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRKAR1A-220ENST00000592194 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.37□□□□□ -1.39
PRKAR1A-220ENST00000592194 H3BPC8 53 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-220ENST00000592194 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-220ENST00000592194 SNURFQ9Y675 71 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-220ENST00000592194 CSAG1Q6PB30 78 aa6.27□□□□□ -1.41
PRKAR1A-220ENST00000592194 SERP2Q8N6R1 65 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-220ENST00000592194 A8MUN3 132 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-220ENST00000592194 DMAC1Q96GE9 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-220ENST00000592194 C20orf197Q8N268 126 aa6.23□□□□□ -1.41
PRKAR1A-220ENST00000592194 NDUFC1O43677 76 aa6.18□□□□□ -1.42
PRKAR1A-220ENST00000592194 MT1BP07438 61 aa6.15□□□□□ -1.42
PRKAR1A-220ENST00000592194 COX7CP15954 63 aa6.14□□□□□ -1.43
PRKAR1A-220ENST00000592194 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.14□□□□□ -1.43
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.11□□□□□ -1.43
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.1□□□□□ -1.43
PRKAR1A-220ENST00000592194 A6NN06 94 aa6.09□□□□□ -1.43
PRKAR1A-220ENST00000592194 ACYP2P14621 99 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.07□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 H0YAA0 97 aa6.06□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 Q5VV11 94 aa6.06□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.06□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP10-5P60370 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PRKAR1A-220ENST00000592194 H7BZZ5 65 aa6.02□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 P0C880 135 aa6.02□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 CCDC179H3BU77 68 aa6.01□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 NEBP20929 6669 aa6□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.99□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.98□□□□□ -1.45
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP5-9P26371 169 aa5.95□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 COA5Q86WW8 74 aa5.95□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 CRIPTQ9P021 101 aa5.94□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.92□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.9□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.9□□□□□ -1.46
PRKAR1A-220ENST00000592194 M0QZ58 72 aa5.85□□□□□ -1.47
PRKAR1A-220ENST00000592194 R4GN34 69 aa5.84□□□□□ -1.47
PRKAR1A-220ENST00000592194 KMT2DO14686 5537 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC01554Q52M75 96 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKAR1A-220ENST00000592194 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 MT1XP80297 61 aa5.71□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 MDN1Q9NU22 5596 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 TMEM258P61165 79 aa5.7□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 PLAC4Q8WY50 150 aa5.67□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.65□□□□□ -1.5
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2EP22531 72 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2BP35325 72 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2AP35326 72 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 SEC61GP60059 68 aa5.62□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.61□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP12-2P59991 146 aa5.59□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.59□□□□□ -1.51
PRKAR1A-220ENST00000592194 A0A1B0GU33 70 aa5.58□□□□□ -1.52
PRKAR1A-220ENST00000592194 A0A1B0GU69 56 aa5.58□□□□□ -1.52
PRKAR1A-220ENST00000592194 A0A0D9SG42 100 aa5.56□□□□□ -1.52
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.55□□□□□ -1.52
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.54□□□□□ -1.52
PRKAR1A-220ENST00000592194 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.52□□□□□ -1.53
PRKAR1A-220ENST00000592194 PCP4P48539 62 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-220ENST00000592194 A8MU10 97 aa5.48□□□□□ -1.53
PRKAR1A-220ENST00000592194 SPRR2DP22532 72 aa5.45□□□□□ -1.54
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP12-1P59990 96 aa5.45□□□□□ -1.54
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PRKAR1A-220ENST00000592194 PRR15LQ9BU68 103 aa5.43□□□□□ -1.54
PRKAR1A-220ENST00000592194 KRTAP10-12P60413 245 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms