RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 BPTFQ12830 3046 aa0□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 LAMA1P25391 3075 aa0□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 ITPR2Q14571 2701 aa-0□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 ATMQ13315 3056 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 TRPM2O94759 1503 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 CENPEQ02224 2701 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 HERC1Q15751 4861 aa-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.04□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 MROH2AA6NES4 1674 aa-0.04□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.04□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.04□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 COL12A1Q99715 3063 aa-0.04□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 FAT1Q14517 4588 aa-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.05□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 NEBP20929 6669 aa-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 LAMA3Q16787 3333 aa-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 MT4P47944 62 aa-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.06□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 TRIOO75962 3097 aa-0.07□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 LAMA5O15230 3695 aa-0.07□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.08□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 FRYLO94915 3013 aa-0.08□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.08□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.08□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 LYSTQ99698 3801 aa-0.08□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CLTCL1P53675 1640 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 USH2AO75445 5202 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 IQGAP2Q13576 1575 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB4AO15263 64 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CUBNO60494 3623 aa-0.09□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 HERC2O95714 4834 aa-0.1□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.1□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.1□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.1□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.1□□□□□ -2.42
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.1□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 LEAP2Q969E1 77 aa-0.1□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 AKAP9Q99996 3911 aa-0.1□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.1□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 IQGAP1P46940 1657 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 NFAT5O94916 1531 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1GP13640 62 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1HP80294 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 RELNP78509 3460 aa-0.11□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.12□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.12□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.12□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1XP80297 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 SPEGQ15772 3267 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.13□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 A0A096LNI7 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 HTN1P15515 57 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1MQ8N339 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MT1LQ93083 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 PCNTO95613 3336 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 RYR1P21817 5038 aa-0.14□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.15□□□□□ -2.43
TMOD3-202ENST00000558300 EP400Q96L91 3159 aa-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms