RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 PKHD1P08F94 4074 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GVY2 172 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 PRAC1Q96KF2 57 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRB-211ENST00000552253 A8MUU9 505 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-211ENST00000552253 LINC01554Q52M75 96 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRB-211ENST00000552253 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-8P60410 259 aa3.1□□□□□ -1.91
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PTPRB-211ENST00000552253 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-211ENST00000552253 M0QZ58 72 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-211ENST00000552253 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRB-211ENST00000552253 MUC17Q685J3 4493 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRB-211ENST00000552253 MT2AP02795 61 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRB-211ENST00000552253 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.46□□□□□ -2.01
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRB-211ENST00000552253 M0R2T5 61 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-10P60014 251 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRB-211ENST00000552253 LCE3AQ5TA76 89 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRB-211ENST00000552253 MT1BP07438 61 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-5P60370 271 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRB-211ENST00000552253 MT1XP80297 61 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRB-211ENST00000552253 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.38□□□□□ -2.03
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