RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 H0Y9P7 68 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-222ENST00000550996 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-222ENST00000550996 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-222ENST00000550996 ATOX1O00244 68 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-222ENST00000550996 OCR1Q9BZK8 76 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-222ENST00000550996 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-222ENST00000550996 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-222ENST00000550996 MT1BP07438 61 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-222ENST00000550996 KLKP1Q107X0 134 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-222ENST00000550996 LINC00208Q96KT6 92 aa9.37□□□□□ -0.91
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CS-222ENST00000550996 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-222ENST00000550996 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-222ENST00000550996 J3QR89 54 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-222ENST00000550996 MP68P56378 58 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-222ENST00000550996 Q5VV11 94 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-222ENST00000550996 A8MUN3 132 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-222ENST00000550996 NDUFC1O43677 76 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-222ENST00000550996 IMUPQ9GZP8 106 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-222ENST00000550996 H0YAA0 97 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-222ENST00000550996 CRIPTQ9P021 101 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-222ENST00000550996 A6NN06 94 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-222ENST00000550996 H3BPC8 53 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-222ENST00000550996 SCGB1A1P11684 91 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-222ENST00000550996 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-222ENST00000550996 MT-ATP8P03928 68 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-222ENST00000550996 KRTAP10-5P60370 271 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-222ENST00000550996 DMAC1Q96GE9 116 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-222ENST00000550996 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-222ENST00000550996 K7ERU9 68 aa9□□□□□ -0.97
CS-222ENST00000550996 P0C880 135 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-222ENST00000550996 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-222ENST00000550996 LCE1DQ5T752 114 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-222ENST00000550996 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-222ENST00000550996 NEBP20929 6669 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-222ENST00000550996 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-222ENST00000550996 R4GN34 69 aa8.83□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 C20orf197Q8N268 126 aa8.82□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 ACYP2P14621 99 aa8.81□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 MT1XP80297 61 aa8.81□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 M0QZ58 72 aa8.8□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 SNURFQ9Y675 71 aa8.8□□□□□ -1
CS-222ENST00000550996 KMT2DO14686 5537 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-222ENST00000550996 PLAC4Q8WY50 150 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-9P26371 169 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-222ENST00000550996 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-222ENST00000550996 MDN1Q9NU22 5596 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-222ENST00000550996 LINC01554Q52M75 96 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-222ENST00000550996 SERP2Q8N6R1 65 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-222ENST00000550996 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-222ENST00000550996 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-222ENST00000550996 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-222ENST00000550996 KRTAP12-2P59991 146 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-222ENST00000550996 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-222ENST00000550996 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-222ENST00000550996 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-222ENST00000550996 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-222ENST00000550996 COX7CP15954 63 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-222ENST00000550996 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-222ENST00000550996 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-222ENST00000550996 KRTAP10-12P60413 245 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-222ENST00000550996 H7BZZ5 65 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-222ENST00000550996 SPRR2EP22531 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-222ENST00000550996 SPRR2BP35325 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-222ENST00000550996 SPRR2AP35326 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-222ENST00000550996 LCE4AQ5TA78 99 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-222ENST00000550996 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-222ENST00000550996 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-222ENST00000550996 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-222ENST00000550996 SEC61GP60059 68 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 A0A0D9SG42 100 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GU33 70 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-222ENST00000550996 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-222ENST00000550996 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-222ENST00000550996 CCDC179H3BU77 68 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-222ENST00000550996 SPRR2DP22532 72 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-222ENST00000550996 KRTAP12-1P59990 96 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-222ENST00000550996 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GU69 56 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-222ENST00000550996 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-222ENST00000550996 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-222ENST00000550996 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-222ENST00000550996 A8MU10 97 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-222ENST00000550996 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-222ENST00000550996 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-222ENST00000550996 MT1EP04732 61 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-222ENST00000550996 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-222ENST00000550996 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.68□□□□□ -1.18
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