RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 P0C880 135 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRB-206ENST00000548122 PLAC4Q8WY50 150 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRB-206ENST00000548122 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
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PTPRB-206ENST00000548122 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRB-206ENST00000548122 MT1HL1P0DM35 61 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRB-206ENST00000548122 M0R2T5 61 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.11□□□□□ -1.91
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PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRB-206ENST00000548122 TNP1P09430 55 aa2.61□□□□□ -1.99
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PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.57□□□□□ -2
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PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRB-206ENST00000548122 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
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PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRB-206ENST00000548122 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRB-206ENST00000548122 LCE1DQ5T752 114 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRB-206ENST00000548122 MT1BP07438 61 aa2.29□□□□□ -2.04
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