RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 H0Y9P7 68 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 H3BPC8 53 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 SPINK1P00995 79 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 MP68P56378 58 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 LINC00313P59037 77 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 LINC00208Q96KT6 92 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 LIMD2Q9BT23 127 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 Q5W150 140 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 LINC00304Q8N9R0 145 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 SERP1Q9Y6X1 66 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 HERC1Q15751 4861 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 NDUFS5O43920 106 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 PKHD1P08F94 4074 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-205ENST00000546248 LCE1CQ5T751 118 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 Q5VSD8 79 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 HSPG2P98160 4391 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 PCOTHQ58A44 107 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.93□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 TNXBP22105 4242 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 A8MUU9 505 aa2.91□□□□□ -1.94
TRDN-205ENST00000546248 C9orf92A6NGG3 77 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 MT1HL1P0DM35 61 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 HRES1P13985 223 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 C4orf26Q17RF5 130 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 COA5Q86WW8 74 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 Q1T7F1 81 aa2.86□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 DMAC1Q96GE9 116 aa2.85□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 ACYP2P14621 99 aa2.84□□□□□ -1.95
TRDN-205ENST00000546248 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.83□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 SPINK7P58062 85 aa2.82□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.82□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 MYCBP2O75592 4640 aa2.8□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 A8MUN3 132 aa2.8□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 V9GYY9 64 aa2.8□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 PSPHP1O15172 72 aa2.79□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 Q5VV11 94 aa2.79□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.79□□□□□ -1.96
TRDN-205ENST00000546248 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.77□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 RNF213Q63HN8 5207 aa2.76□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 SEC61GP60059 68 aa2.76□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 TPRXLQ17RH7 258 aa2.76□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.76□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 PRR15LQ9BU68 103 aa2.76□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.72□□□□□ -1.97
TRDN-205ENST00000546248 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 LCA10Q71F78 164 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 BRK1Q8WUW1 75 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 PRO0628Q9UI54 55 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 MUC17Q685J3 4493 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 A0A1B0GU69 56 aa2.69□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.69□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 LPAP08519 4548 aa2.69□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 LRP2P98164 4655 aa2.68□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 A6NED7 52 aa2.68□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.68□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.67□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.66□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.66□□□□□ -1.98
TRDN-205ENST00000546248 MUC2Q02817 5179 aa2.65□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 PP632Q6XCG6 107 aa2.64□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 S4R3F8 94 aa2.64□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 UQCR11O14957 56 aa2.63□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.63□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.63□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.62□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.61□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 A0A1B0GU33 70 aa2.61□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 A6NN06 94 aa2.59□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 H0YAA0 97 aa2.59□□□□□ -1.99
TRDN-205ENST00000546248 PMAIP1Q13794 54 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 CSAG1Q6PB30 78 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 P0C880 135 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.53□□□□□ -2
TRDN-205ENST00000546248 A0A0D9SG42 100 aa2.49□□□□□ -2.01
TRDN-205ENST00000546248 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms