RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZZEF1O43149 2961 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 HIVEP1P15822 2718 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 UNC80Q8N2C7 3258 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 EYSQ5T1H1 3165 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACACAQ13085 2346 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 DCHS1Q96JQ0 3298 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 EP400Q96L91 3159 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-347P-201ENST00000516658 CENPFP49454 3210 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 RELNP78509 3460 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 LYSTQ99698 3801 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACACBO00763 2458 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 C5orf42Q9H799 3197 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 PKD1P98161 4303 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 HERC2O95714 4834 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPG11Q96JI7 2443 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 TGP01266 2768 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 MUC3AQ02505 3323 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 LAMA3Q16787 3333 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 ITPR2Q14571 2701 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 BRCA2P51587 3418 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-347P-201ENST00000516658 TACC2O95359 2948 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 COL7A1Q02388 2944 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1AP04731 61 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRBAP50851 2863 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 USP34Q70CQ2 3546 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 LEAP2Q969E1 77 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 HSPG2P98160 4391 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 HTTP42858 3142 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 UTRNP46939 3433 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM186AA6NE01 2351 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 PHGR1C9JFL3 82 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPRR2EP22531 72 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 LAMA5O15230 3695 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 MYO15AQ9UKN7 3530 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 PKHD1P08F94 4074 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 USH2AO75445 5202 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH14Q0VDD8 3507 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 CEP250Q9BV73 2442 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 CUBNO60494 3623 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 CFAP54Q96N23 3096 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 LAMA1P25391 3075 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 FRYLO94915 3013 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH2Q9P225 4427 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 VPS13CQ709C8 3753 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 CENPEQ02224 2701 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 FRYQ5TBA9 3013 aa0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92 ms