RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-211ENST00000513325 IMUPQ9GZP8 106 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-211ENST00000513325 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-211ENST00000513325 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-211ENST00000513325 ETDBQ3ZM63 59 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 F8W1H4 67 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 KMT2DO14686 5537 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 NDUFC1O43677 76 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 H0YAA0 97 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-211ENST00000513325 H0Y9P7 68 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-211ENST00000513325 UQCRQO14949 82 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-211ENST00000513325 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-211ENST00000513325 MDN1Q9NU22 5596 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-211ENST00000513325 A8MUN3 132 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-211ENST00000513325 ATOX1O00244 68 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 ACYP1P07311 99 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 MT1XP80297 61 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-211ENST00000513325 SPRR2EP22531 72 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 SPRR2BP35325 72 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 SPRR2AP35326 72 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 PLAC4Q8WY50 150 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 LINC00208Q96KT6 92 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-211ENST00000513325 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-211ENST00000513325 R4GN34 69 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-211ENST00000513325 P0C880 135 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP12-2P59991 146 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-211ENST00000513325 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 MP68P56378 58 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 M0QZ58 72 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 LINC00643Q86TS7 51 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 OCR1Q9BZK8 76 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 C20orf197Q8N268 126 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-211ENST00000513325 LINC01554Q52M75 96 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-211ENST00000513325 SPRR2DP22532 72 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-211ENST00000513325 DMAC1Q96GE9 116 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-211ENST00000513325 H3BPC8 53 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-12P60413 245 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-211ENST00000513325 SCGB1A1P11684 91 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-211ENST00000513325 LCE3BQ5TA77 95 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-211ENST00000513325 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-211ENST00000513325 MT-ATP8P03928 68 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-211ENST00000513325 ACYP2P14621 99 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GV90 55 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-211ENST00000513325 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-211ENST00000513325 J3QR89 54 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-211ENST00000513325 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-211ENST00000513325 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-211ENST00000513325 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-211ENST00000513325 SNURFQ9Y675 71 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-211ENST00000513325 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-211ENST00000513325 MT1EP04732 61 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-211ENST00000513325 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC3-211ENST00000513325 A0A0D9SG42 100 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 K7ERU9 68 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.17□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 COA5Q86WW8 74 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-211ENST00000513325 MT1GP13640 62 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 SERP2Q8N6R1 65 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 SEC61GP60059 68 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 LCE1DQ5T752 114 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-211ENST00000513325 PP632Q6XCG6 107 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP12-1P59990 96 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GU33 70 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-211ENST00000513325 LCE4AQ5TA78 99 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-211ENST00000513325 MT1MQ8N339 61 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-211ENST00000513325 MT4P47944 62 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-211ENST00000513325 MT1LQ93083 61 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC3-211ENST00000513325 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-211ENST00000513325 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-211ENST00000513325 LCE3AQ5TA76 89 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.88□□□□□ -1.47
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