RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.24□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 RYR2Q92736 4967 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 A6NED7 52 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 HRES1P13985 223 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.23□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINK7P58062 85 aa2.22□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCOTHQ58A44 107 aa2.22□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.22□□□□□ -2.05
TIMMDC1-209ENST00000498399 LYSTQ99698 3801 aa2.21□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.21□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.21□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q6ZSA8 131 aa2.21□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.21□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 A8MUU9 505 aa2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.2□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 HERC2O95714 4834 aa2.19□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.19□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 C8orf87E5RJ46 101 aa2.18□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 COL7A1Q02388 2944 aa2.18□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 TENM2Q9NT68 2774 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINK1P00995 79 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACYP2P14621 99 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00313P59037 77 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.17□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 LUZP6Q538Z0 58 aa2.16□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.16□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.16□□□□□ -2.06
TIMMDC1-209ENST00000498399 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 DMAC1Q96GE9 116 aa2.15□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.14□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.14□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.11□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GU69 56 aa2.11□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.11□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q5VSD8 79 aa2.11□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 UQCR11O14957 56 aa2.1□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01554Q52M75 96 aa2.1□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.1□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.1□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.1□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.09□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 C9orf92A6NGG3 77 aa2.09□□□□□ -2.07
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.09□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.09□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 HERC1Q15751 4861 aa2.08□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.07□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSAG1Q6PB30 78 aa2.07□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 KMT2AQ03164 3969 aa2.07□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKHD1P08F94 4074 aa2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH2Q9P225 4427 aa2.03□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 H0YAA0 97 aa2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSPG2P98160 4391 aa2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GU33 70 aa2□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPL37P61927 97 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 R4GN34 69 aa1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKD1P98161 4303 aa1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 P0C880 135 aa1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 MT1HL1P0DM35 61 aa1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ROMO1P60602 79 aa1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7ERS5 55 aa1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 TPRXLQ17RH7 258 aa1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYCBP2O75592 4640 aa1.93□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRIPTQ9P021 101 aa1.93□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.93□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.93□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 S4R3F8 94 aa1.92□□□□□ -2.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF213Q63HN8 5207 aa1.9□□□□□ -2.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.9□□□□□ -2.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAT1Q14517 4588 aa1.89□□□□□ -2.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.89□□□□□ -2.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms