RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491572.1

UBE2Q1-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 235 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.45□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNXBP22105 4242 aa4.44□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP10-2P60368 255 aa4.43□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 LCE2BO14633 110 aa4.42□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.42□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.41□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
UBE2Q1-206ENST00000491572 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.4□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 CSAG1Q6PB30 78 aa4.38□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.37□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.36□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 A8MUU9 505 aa4.34□□□□□ -1.71
UBE2Q1-206ENST00000491572 H3BS24 57 aa4.33□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 K7ERS5 55 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPINK1P00995 79 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP10-1P60331 282 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.29□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 A0A1B0GU33 70 aa4.28□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 Q6ZSA8 131 aa4.28□□□□□ -1.72
UBE2Q1-206ENST00000491572 LPAP08519 4548 aa4.27□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.27□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 H0YAA0 97 aa4.26□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 ROMO1P60602 79 aa4.26□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.26□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 MT1HL1P0DM35 61 aa4.25□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.23□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 LCE2CQ5TA81 110 aa4.22□□□□□ -1.73
UBE2Q1-206ENST00000491572 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.21□□□□□ -1.74
UBE2Q1-206ENST00000491572 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.21□□□□□ -1.74
UBE2Q1-206ENST00000491572 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.19□□□□□ -1.74
UBE2Q1-206ENST00000491572 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.13□□□□□ -1.75
UBE2Q1-206ENST00000491572 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
UBE2Q1-206ENST00000491572 SSPOA2VEC9 5147 aa4.05□□□□□ -1.76
UBE2Q1-206ENST00000491572 P0C880 135 aa4.05□□□□□ -1.76
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.02□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 CRIPTQ9P021 101 aa4.02□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 C9orf92A6NGG3 77 aa4□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 TPRXLQ17RH7 258 aa3.98□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.98□□□□□ -1.77
UBE2Q1-206ENST00000491572 USH2AO75445 5202 aa3.95□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 S4R3F8 94 aa3.95□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP10-8P60410 259 aa3.94□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 MUC17Q685J3 4493 aa3.93□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 M0QZ58 72 aa3.93□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.92□□□□□ -1.78
UBE2Q1-206ENST00000491572 XP32Q5T750 250 aa3.9□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 A0A0D9SG42 100 aa3.89□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 NDUFAF8A1L188 74 aa3.88□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP12-1P59990 96 aa3.86□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 NEBP20929 6669 aa3.85□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP12-2P59991 146 aa3.84□□□□□ -1.79
UBE2Q1-206ENST00000491572 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.83□□□□□ -1.8
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.76□□□□□ -1.81
UBE2Q1-206ENST00000491572 PP632Q6XCG6 107 aa3.75□□□□□ -1.81
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.73□□□□□ -1.81
UBE2Q1-206ENST00000491572 PLAC4Q8WY50 150 aa3.72□□□□□ -1.81
UBE2Q1-206ENST00000491572 MT1HP80294 61 aa3.69□□□□□ -1.82
UBE2Q1-206ENST00000491572 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.67□□□□□ -1.82
UBE2Q1-206ENST00000491572 LUZP6Q538Z0 58 aa3.67□□□□□ -1.82
UBE2Q1-206ENST00000491572 A0A0A0MQY5 61 aa3.66□□□□□ -1.82
UBE2Q1-206ENST00000491572 R4GN34 69 aa3.66□□□□□ -1.82
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.65□□□□□ -1.83
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.64□□□□□ -1.83
UBE2Q1-206ENST00000491572 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.64□□□□□ -1.83
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.6□□□□□ -1.83
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.59□□□□□ -1.83
UBE2Q1-206ENST00000491572 KMT2DO14686 5537 aa3.56□□□□□ -1.84
UBE2Q1-206ENST00000491572 M0R2T5 61 aa3.54□□□□□ -1.84
UBE2Q1-206ENST00000491572 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
UBE2Q1-206ENST00000491572 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 MDN1Q9NU22 5596 aa3.48□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.48□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.48□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNP1P09430 55 aa3.47□□□□□ -1.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.44□□□□□ -1.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2Q1-206ENST00000491572 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2Q1-206ENST00000491572 INE1O15225 51 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.33□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.33□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.3□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.3□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP5-9P26371 169 aa3.29□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.29□□□□□ -1.88
UBE2Q1-206ENST00000491572 MT2AP02795 61 aa3.26□□□□□ -1.89
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.24□□□□□ -1.89
UBE2Q1-206ENST00000491572 MT1FP04733 61 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms