RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 C5orf47Q569G3 176 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-210ENST00000491139 J3QR89 54 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-210ENST00000491139 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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NELFE-210ENST00000491139 CSAG1Q6PB30 78 aa9.18□□□□□ -0.94
NELFE-210ENST00000491139 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.18□□□□□ -0.94
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NELFE-210ENST00000491139 S4R3F8 94 aa9.16□□□□□ -0.94
NELFE-210ENST00000491139 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.13□□□□□ -0.95
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NELFE-210ENST00000491139 H0Y9P7 68 aa9.11□□□□□ -0.95
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NELFE-210ENST00000491139 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.83□□□□□ -1
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NELFE-210ENST00000491139 MT1XP80297 61 aa8.73□□□□□ -1.01
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NELFE-210ENST00000491139 LCE3BQ5TA77 95 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-210ENST00000491139 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-210ENST00000491139 SERP2Q8N6R1 65 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-210ENST00000491139 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.53□□□□□ -1.04
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NELFE-210ENST00000491139 C20orf197Q8N268 126 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-210ENST00000491139 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-210ENST00000491139 SNURFQ9Y675 71 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-210ENST00000491139 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.4□□□□□ -1.06
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NELFE-210ENST00000491139 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-210ENST00000491139 COX7CP15954 63 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP10-12P60413 245 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-210ENST00000491139 M0QZ58 72 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-210ENST00000491139 LINC01554Q52M75 96 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-210ENST00000491139 H7BZZ5 65 aa8.17□□□□□ -1.1
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.15□□□□□ -1.1
NELFE-210ENST00000491139 COA5Q86WW8 74 aa8.14□□□□□ -1.11
NELFE-210ENST00000491139 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-210ENST00000491139 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-210ENST00000491139 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.95□□□□□ -1.14
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NELFE-210ENST00000491139 CCDC179H3BU77 68 aa7.91□□□□□ -1.14
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NELFE-210ENST00000491139 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
NELFE-210ENST00000491139 LCE1DQ5T752 114 aa7.88□□□□□ -1.15
NELFE-210ENST00000491139 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.88□□□□□ -1.15
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.85□□□□□ -1.15
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NELFE-210ENST00000491139 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-210ENST00000491139 TMEM258P61165 79 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-210ENST00000491139 MT4P47944 62 aa7.73□□□□□ -1.17
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NELFE-210ENST00000491139 A0A1B0GU69 56 aa7.71□□□□□ -1.18
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NELFE-210ENST00000491139 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-210ENST00000491139 A0A0D9SG42 100 aa7.61□□□□□ -1.19
NELFE-210ENST00000491139 MT1GP13640 62 aa7.61□□□□□ -1.19
NELFE-210ENST00000491139 PRR15LQ9BU68 103 aa7.58□□□□□ -1.2
NELFE-210ENST00000491139 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.57□□□□□ -1.2
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP12-1P59990 96 aa7.57□□□□□ -1.2
NELFE-210ENST00000491139 PP632Q6XCG6 107 aa7.56□□□□□ -1.2
NELFE-210ENST00000491139 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.56□□□□□ -1.2
NELFE-210ENST00000491139 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.47□□□□□ -1.21
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