RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATXN8Q156A1 80 aa6.24□□□□□ -1.41
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SDCCAG3-211ENST00000486441 UQCRQO14949 82 aa6.21□□□□□ -1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDE6GP18545 87 aa6.21□□□□□ -1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLKP1Q107X0 134 aa6.19□□□□□ -1.42
SDCCAG3-211ENST00000486441 LCA10Q71F78 164 aa6.19□□□□□ -1.42
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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SDCCAG3-211ENST00000486441 C20orf197Q8N268 126 aa5.76□□□□□ -1.49
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SDCCAG3-211ENST00000486441 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.68□□□□□ -1.5
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SDCCAG3-211ENST00000486441 LCE1DQ5T752 114 aa5.4□□□□□ -1.54
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.4□□□□□ -1.54
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.36□□□□□ -1.55
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PSPHP1O15172 72 aa5.32□□□□□ -1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 MP68P56378 58 aa5.32□□□□□ -1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 DMAC1Q96GE9 116 aa5.32□□□□□ -1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.3□□□□□ -1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.28□□□□□ -1.56
SDCCAG3-211ENST00000486441 MT4P47944 62 aa5.24□□□□□ -1.57
SDCCAG3-211ENST00000486441 LCE4AQ5TA78 99 aa5.24□□□□□ -1.57
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.24□□□□□ -1.57
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRR15LQ9BU68 103 aa5.23□□□□□ -1.57
SDCCAG3-211ENST00000486441 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.23□□□□□ -1.57
SDCCAG3-211ENST00000486441 A6NED7 52 aa5.21□□□□□ -1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 MT1GP13640 62 aa5.18□□□□□ -1.58
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.18□□□□□ -1.58
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