RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SCGB1A1P11684 91 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 MT-ATP8P03928 68 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 IMUPQ9GZP8 106 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 A8MUN3 132 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 H3BPC8 53 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-211ENST00000480301 NDUFC1O43677 76 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-211ENST00000480301 H0YAA0 97 aa9.37□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.36□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 MT1BP07438 61 aa9.35□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.35□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 DMAC1Q96GE9 116 aa9.35□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.34□□□□□ -0.91
ACTB-211ENST00000480301 CRIPTQ9P021 101 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-211ENST00000480301 Q5VV11 94 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-211ENST00000480301 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-211ENST00000480301 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
ACTB-211ENST00000480301 SNURFQ9Y675 71 aa9.15□□□□□ -0.94
ACTB-211ENST00000480301 A6NN06 94 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-211ENST00000480301 ACYP2P14621 99 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-211ENST00000480301 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-211ENST00000480301 P0C880 135 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTB-211ENST00000480301 SERP2Q8N6R1 65 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-5P60370 271 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-211ENST00000480301 C20orf197Q8N268 126 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-211ENST00000480301 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-211ENST00000480301 R4GN34 69 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-211ENST00000480301 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-211ENST00000480301 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-211ENST00000480301 M0QZ58 72 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-211ENST00000480301 COX7CP15954 63 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-211ENST00000480301 PLAC4Q8WY50 150 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-211ENST00000480301 MT1XP80297 61 aa8.81□□□□□ -1
ACTB-211ENST00000480301 LINC01554Q52M75 96 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-211ENST00000480301 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-211ENST00000480301 COA5Q86WW8 74 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-211ENST00000480301 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-211ENST00000480301 H7BZZ5 65 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-9P26371 169 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-211ENST00000480301 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-211ENST00000480301 NEBP20929 6669 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-211ENST00000480301 KMT2DO14686 5537 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP12-2P59991 146 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-211ENST00000480301 CCDC179H3BU77 68 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-211ENST00000480301 SEC61GP60059 68 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTB-211ENST00000480301 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-12P60413 245 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GU33 70 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-211ENST00000480301 MDN1Q9NU22 5596 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-211ENST00000480301 A0A0D9SG42 100 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-211ENST00000480301 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-211ENST00000480301 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GU69 56 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2EP22531 72 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2BP35325 72 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2AP35326 72 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.18□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP12-1P59990 96 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTB-211ENST00000480301 TMEM258P61165 79 aa8.14□□□□□ -1.11
ACTB-211ENST00000480301 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTB-211ENST00000480301 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTB-211ENST00000480301 A8MU10 97 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTB-211ENST00000480301 PRR15LQ9BU68 103 aa8.06□□□□□ -1.12
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.02□□□□□ -1.13
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.02□□□□□ -1.13
ACTB-211ENST00000480301 SPRR2DP22532 72 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.88□□□□□ -1.15
ACTB-211ENST00000480301 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.82□□□□□ -1.16
ACTB-211ENST00000480301 UQCR11O14957 56 aa7.81□□□□□ -1.16
ACTB-211ENST00000480301 MT1EP04732 61 aa7.8□□□□□ -1.16
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.72□□□□□ -1.17
ACTB-211ENST00000480301 TNP1P09430 55 aa7.7□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 LCE3BQ5TA77 95 aa7.7□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.68□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.68□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.65□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 Q1T7F1 81 aa7.65□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 V9GYY9 64 aa7.65□□□□□ -1.18
ACTB-211ENST00000480301 LCE3AQ5TA76 89 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-211ENST00000480301 PSPHP1O15172 72 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-211ENST00000480301 MT1GP13640 62 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-211ENST00000480301 MT1LQ93083 61 aa7.48□□□□□ -1.21
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