RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OCR1Q9BZK8 76 aa2.85□□□□□ -1.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A8MUU9 505 aa2.84□□□□□ -1.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MP68P56378 58 aa2.84□□□□□ -1.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.84□□□□□ -1.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.83□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H3BPC8 53 aa2.83□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.83□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRAC1Q96KF2 57 aa2.83□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX7CP15954 63 aa2.82□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H0Y9P7 68 aa2.81□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 V9GYY9 64 aa2.81□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.8□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NDUFC1O43677 76 aa2.79□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.79□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KLKP1Q107X0 134 aa2.78□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q5W150 140 aa2.78□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.78□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C20orf197Q8N268 126 aa2.78□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00208Q96KT6 92 aa2.78□□□□□ -1.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.77□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 M0R2T5 61 aa2.76□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.76□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USH2AO75445 5202 aa2.75□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC179H3BU77 68 aa2.75□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.75□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SNURFQ9Y675 71 aa2.75□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SSPOA2VEC9 5147 aa2.74□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPINK7P58062 85 aa2.74□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRO0628Q9UI54 55 aa2.73□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.72□□□□□ -1.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H7BZZ5 65 aa2.71□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM258P61165 79 aa2.71□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.71□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A8MUN3 132 aa2.7□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HRES1P13985 223 aa2.7□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.7□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.68□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM236CP0DP71 79 aa2.68□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ACYP2P14621 99 aa2.68□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C4orf26Q17RF5 130 aa2.68□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.68□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.66□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DMAC1Q96GE9 116 aa2.66□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MT2AP02795 61 aa2.65□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP5-9P26371 169 aa2.65□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MT1FP04733 61 aa2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.63□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.62□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COA5Q86WW8 74 aa2.6□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 S4R3F8 94 aa2.6□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PMAIP1Q13794 54 aa2.59□□□□□ -1.99
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP10-10P60014 251 aa2.58□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NDUFAF8A1L188 74 aa2.57□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LCA10Q71F78 164 aa2.57□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.56□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CSAG1Q6PB30 78 aa2.56□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.55□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.55□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.55□□□□□ -2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRR15LQ9BU68 103 aa2.52□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H0YAA0 97 aa2.51□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q1T7F1 81 aa2.51□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.5□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.5□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1B0GU69 56 aa2.49□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.49□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEBP20929 6669 aa2.48□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.47□□□□□ -2.01
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.46□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.45□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRIPTQ9P021 101 aa2.44□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.44□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UQCR11O14957 56 aa2.43□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PSPHP1O15172 72 aa2.43□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1B0GU33 70 aa2.42□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 M0QZ58 72 aa2.42□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MT3P25713 68 aa2.42□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 P0C880 135 aa2.41□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q5VV11 94 aa2.41□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BRK1Q8WUW1 75 aa2.41□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.41□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 R4GN34 69 aa2.41□□□□□ -2.02
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MT1BP07438 61 aa2.4□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.4□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A6NED7 52 aa2.39□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A6NN06 94 aa2.37□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.37□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP10-5P60370 271 aa2.36□□□□□ -2.03
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LCE1EQ5T753 118 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms