RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 A0A087WVE0 104 aa10.5□□□□□ -0.73
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C9orf3-215ENST00000478473 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
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C9orf3-215ENST00000478473 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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C9orf3-215ENST00000478473 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-215ENST00000478473 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-215ENST00000478473 TNP1P09430 55 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-215ENST00000478473 PP632Q6XCG6 107 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-215ENST00000478473 MT1LQ93083 61 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-215ENST00000478473 LCE3AQ5TA76 89 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM258P61165 79 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-215ENST00000478473 MT1MQ8N339 61 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-215ENST00000478473 UQCR11O14957 56 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.2□□□□□ -1.1
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