RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 SCGB1A1P11684 91 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 IMUPQ9GZP8 106 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 K7ERU9 68 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-211ENST00000476336 NDUFC1O43677 76 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.13□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 KLKP1Q107X0 134 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 CRIPTQ9P021 101 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-211ENST00000476336 H0YAA0 97 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-211ENST00000476336 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.06□□□□□ -1.44
PRAME-211ENST00000476336 MT-ATP8P03928 68 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 Q5VV11 94 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 DMAC1Q96GE9 116 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-211ENST00000476336 ACYP2P14621 99 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-211ENST00000476336 C20orf197Q8N268 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-211ENST00000476336 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-211ENST00000476336 MT1BP07438 61 aa5.91□□□□□ -1.46
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PRAME-211ENST00000476336 A6NN06 94 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-211ENST00000476336 SERP2Q8N6R1 65 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-211ENST00000476336 R4GN34 69 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-5P60370 271 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 SNURFQ9Y675 71 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-211ENST00000476336 P0C880 135 aa5.76□□□□□ -1.49
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PRAME-211ENST00000476336 NEBP20929 6669 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-211ENST00000476336 M0QZ58 72 aa5.74□□□□□ -1.49
PRAME-211ENST00000476336 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.73□□□□□ -1.49
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.72□□□□□ -1.49
PRAME-211ENST00000476336 COX7CP15954 63 aa5.68□□□□□ -1.5
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP5-9P26371 169 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-211ENST00000476336 LINC01554Q52M75 96 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-211ENST00000476336 MT1XP80297 61 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 COA5Q86WW8 74 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 KMT2DO14686 5537 aa5.57□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 SEC61GP60059 68 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 MDN1Q9NU22 5596 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 H7BZZ5 65 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.53□□□□□ -1.52
PRAME-211ENST00000476336 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP12-2P59991 146 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.45□□□□□ -1.54
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.45□□□□□ -1.54
PRAME-211ENST00000476336 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.45□□□□□ -1.54
PRAME-211ENST00000476336 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.4□□□□□ -1.54
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PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GU33 70 aa5.38□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.37□□□□□ -1.55
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PRAME-211ENST00000476336 SPRR2BP35325 72 aa5.36□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 SPRR2AP35326 72 aa5.36□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GU69 56 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 CCDC179H3BU77 68 aa5.34□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-12P60413 245 aa5.34□□□□□ -1.55
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.29□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 A0A0D9SG42 100 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 PRR15LQ9BU68 103 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.27□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.27□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 TMEM258P61165 79 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP12-1P59990 96 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-211ENST00000476336 SPRR2DP22532 72 aa5.18□□□□□ -1.58
PRAME-211ENST00000476336 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.18□□□□□ -1.58
PRAME-211ENST00000476336 A8MU10 97 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-211ENST00000476336 UQCR11O14957 56 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-211ENST00000476336 LCE3BQ5TA77 95 aa5.07□□□□□ -1.6
PRAME-211ENST00000476336 V9GYY9 64 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-211ENST00000476336 TNP1P09430 55 aa5□□□□□ -1.61
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.98□□□□□ -1.61
PRAME-211ENST00000476336 MT1EP04732 61 aa4.94□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.94□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.93□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 Q1T7F1 81 aa4.93□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 K7ERS5 55 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.88□□□□□ -1.63
PRAME-211ENST00000476336 PP632Q6XCG6 107 aa4.86□□□□□ -1.63
PRAME-211ENST00000476336 PSPHP1O15172 72 aa4.85□□□□□ -1.63
PRAME-211ENST00000476336 MT1GP13640 62 aa4.85□□□□□ -1.63
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