RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959		J3QR89	54 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5	□□□□□ -1.61
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1B	P07438	61 aa		5	□□□□□ -1.61
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTPBP1-208	ENST00000475959	MP68	P56378	58 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959		A8MUN3	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFC1	O43677	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BPC8	53 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7ERU9	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q5VV11	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTPBP1-208	ENST00000475959		H0YAA0	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959		A6NN06	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTPBP1-208	ENST00000475959		P0C880	135 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GTPBP1-208	ENST00000475959	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0QZ58	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACYP2	P14621	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTPBP1-208	ENST00000475959	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTPBP1-208	ENST00000475959		R4GN34	69 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1X	P80297	61 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	COX7C	P15954	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTPBP1-208	ENST00000475959	COA5	Q86WW8	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTPBP1-208	ENST00000475959	KMT2D	O14686	5537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GTPBP1-208	ENST00000475959		H7BZZ5	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEB	P20929	6669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.44	□□□□□ -1.7
GTPBP1-208	ENST00000475959	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.4	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2E	P22531	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2B	P35325	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2A	P35326	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0D9SG42	100 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC61G	P60059	68 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GU33	70 aa		4.34	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.34	□□□□□ -1.71
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.31	□□□□□ -1.72
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GU69	56 aa		4.29	□□□□□ -1.72
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.29	□□□□□ -1.72
GTPBP1-208	ENST00000475959		A8MU10	97 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR2D	P22532	72 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM258	P61165	79 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1E	P04732	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTPBP1-208	ENST00000475959	UQCR11	O14957	56 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNP1	P09430	55 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1L	Q93083	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSPHP1	O15172	72 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.96	□□□□□ -1.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1M	Q8N339	61 aa		3.95	□□□□□ -1.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1G	P13640	62 aa		3.94	□□□□□ -1.78
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q1T7F1	81 aa		3.93	□□□□□ -1.78

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