RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.38□□□□□ -1.55
SOGA3-205ENST00000473298 UQCR11O14957 56 aa5.35□□□□□ -1.55
SOGA3-205ENST00000473298 CSAG1Q6PB30 78 aa5.34□□□□□ -1.55
SOGA3-205ENST00000473298 LRP2P98164 4655 aa5.32□□□□□ -1.56
SOGA3-205ENST00000473298 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.31□□□□□ -1.56
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP10-8P60410 259 aa5.29□□□□□ -1.56
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.29□□□□□ -1.56
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SOGA3-205ENST00000473298 A8MUU9 505 aa5.27□□□□□ -1.57
SOGA3-205ENST00000473298 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.26□□□□□ -1.57
SOGA3-205ENST00000473298 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.25□□□□□ -1.57
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SOGA3-205ENST00000473298 MT1HL1P0DM35 61 aa5.22□□□□□ -1.57
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SOGA3-205ENST00000473298 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.17□□□□□ -1.58
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SOGA3-205ENST00000473298 M0QZ58 72 aa4.96□□□□□ -1.61
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SOGA3-205ENST00000473298 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.96□□□□□ -1.62
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SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SOGA3-205ENST00000473298 R4GN34 69 aa4.93□□□□□ -1.62
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.91□□□□□ -1.62
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SOGA3-205ENST00000473298 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.57□□□□□ -1.68
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SOGA3-205ENST00000473298 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.11□□□□□ -1.75
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SOGA3-205ENST00000473298 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.85□□□□□ -1.79
SOGA3-205ENST00000473298 SSPOA2VEC9 5147 aa3.85□□□□□ -1.79
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.85□□□□□ -1.79
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SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.82□□□□□ -1.8
SOGA3-205ENST00000473298 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.82□□□□□ -1.8
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.75□□□□□ -1.81
SOGA3-205ENST00000473298 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.69□□□□□ -1.82
SOGA3-205ENST00000473298 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.69□□□□□ -1.82
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