RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RYR3Q15413 4870 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0D9SG42 100 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 P0C880 135 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GVY2 172 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-206ENST00000469947 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1-206ENST00000469947 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1-206ENST00000469947 TPRXLQ17RH7 258 aa7□□□□□ -1.29
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1-206ENST00000469947 HSPG2P98160 4391 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP10-8P60410 259 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1-206ENST00000469947 MYCBP2O75592 4640 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1-206ENST00000469947 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1-206ENST00000469947 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP12-2P59991 146 aa6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-206ENST00000469947 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFAF8A1L188 74 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1-206ENST00000469947 Q5VSD8 79 aa6.77□□□□□ -1.33
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SH3BP1-206ENST00000469947 XP32Q5T750 250 aa6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1-206ENST00000469947 TNXBP22105 4242 aa6.73□□□□□ -1.33
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-206ENST00000469947 LRP2P98164 4655 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-206ENST00000469947 M0QZ58 72 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-206ENST00000469947 MT1HL1P0DM35 61 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-206ENST00000469947 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-206ENST00000469947 HERC2O95714 4834 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-206ENST00000469947 R4GN34 69 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-206ENST00000469947 PLAC4Q8WY50 150 aa6.35□□□□□ -1.39
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-206ENST00000469947 HERC1Q15751 4861 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PP632Q6XCG6 107 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC17Q685J3 4493 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC2Q02817 5179 aa6.04□□□□□ -1.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.53□□□□□ -1.52
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SH3BP1-206ENST00000469947 M0R2T5 61 aa5.49□□□□□ -1.53
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.41□□□□□ -1.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 MT1FP04733 61 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1-206ENST00000469947 MT2AP02795 61 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP12-3P60328 96 aa5.29□□□□□ -1.56
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP1-206ENST00000469947 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SSPOA2VEC9 5147 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-206ENST00000469947 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.69□□□□□ -1.66
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