RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 A0A1B0GU33 70 aa7.54□□□□□ -1.2
GPC1-208ENST00000469694 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GPC1-208ENST00000469694 TNXBP22105 4242 aa7.53□□□□□ -1.2
GPC1-208ENST00000469694 C9orf92A6NGG3 77 aa7.52□□□□□ -1.21
GPC1-208ENST00000469694 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GPC1-208ENST00000469694 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.49□□□□□ -1.21
GPC1-208ENST00000469694 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.46□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 P0C880 135 aa7.46□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 CRIPTQ9P021 101 aa7.46□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP10-8P60410 259 aa7.45□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 K7ERS5 55 aa7.41□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.41□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.4□□□□□ -1.22
GPC1-208ENST00000469694 MT1HL1P0DM35 61 aa7.36□□□□□ -1.23
GPC1-208ENST00000469694 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.34□□□□□ -1.24
GPC1-208ENST00000469694 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.31□□□□□ -1.24
GPC1-208ENST00000469694 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.3□□□□□ -1.24
GPC1-208ENST00000469694 TPRXLQ17RH7 258 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC1-208ENST00000469694 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC1-208ENST00000469694 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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GPC1-208ENST00000469694 XP32Q5T750 250 aa7.18□□□□□ -1.26
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.15□□□□□ -1.26
GPC1-208ENST00000469694 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.15□□□□□ -1.26
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.14□□□□□ -1.27
GPC1-208ENST00000469694 NDUFAF8A1L188 74 aa7.13□□□□□ -1.27
GPC1-208ENST00000469694 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.12□□□□□ -1.27
GPC1-208ENST00000469694 A0A0D9SG42 100 aa7.11□□□□□ -1.27
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.06□□□□□ -1.28
GPC1-208ENST00000469694 J3QL48 77 aa7.05□□□□□ -1.28
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GPC1-208ENST00000469694 S4R3F8 94 aa6.98□□□□□ -1.29
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP12-2P59991 146 aa6.94□□□□□ -1.3
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.79□□□□□ -1.32
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GPC1-208ENST00000469694 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GPC1-208ENST00000469694 MUC17Q685J3 4493 aa6.75□□□□□ -1.33
GPC1-208ENST00000469694 A0A0A0MQY5 61 aa6.71□□□□□ -1.33
GPC1-208ENST00000469694 M0QZ58 72 aa6.7□□□□□ -1.34
GPC1-208ENST00000469694 PLAC4Q8WY50 150 aa6.61□□□□□ -1.35
GPC1-208ENST00000469694 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.6□□□□□ -1.35
GPC1-208ENST00000469694 LUZP6Q538Z0 58 aa6.59□□□□□ -1.35
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.55□□□□□ -1.36
GPC1-208ENST00000469694 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.54□□□□□ -1.36
GPC1-208ENST00000469694 R4GN34 69 aa6.42□□□□□ -1.38
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GPC1-208ENST00000469694 LCE2CQ5TA81 110 aa6.34□□□□□ -1.39
GPC1-208ENST00000469694 PP632Q6XCG6 107 aa6.33□□□□□ -1.4
GPC1-208ENST00000469694 M0R2T5 61 aa6.2□□□□□ -1.42
GPC1-208ENST00000469694 MT1HP80294 61 aa6.2□□□□□ -1.42
GPC1-208ENST00000469694 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.15□□□□□ -1.43
GPC1-208ENST00000469694 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.09□□□□□ -1.43
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GPC1-208ENST00000469694 MT1FP04733 61 aa6□□□□□ -1.45
GPC1-208ENST00000469694 MT2AP02795 61 aa6□□□□□ -1.45
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.99□□□□□ -1.45
GPC1-208ENST00000469694 TNP1P09430 55 aa5.99□□□□□ -1.45
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP10-10P60014 251 aa5.98□□□□□ -1.45
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.95□□□□□ -1.46
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GPC1-208ENST00000469694 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.85□□□□□ -1.47
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.75□□□□□ -1.49
GPC1-208ENST00000469694 USH2AO75445 5202 aa5.73□□□□□ -1.49
GPC1-208ENST00000469694 INE1O15225 51 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC1-208ENST00000469694 MT1BP07438 61 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.69□□□□□ -1.5
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GPC1-208ENST00000469694 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
GPC1-208ENST00000469694 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.05□□□□□ -1.6
GPC1-208ENST00000469694 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.96□□□□□ -1.62
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.93□□□□□ -1.62
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.91□□□□□ -1.62
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.91□□□□□ -1.62
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.91□□□□□ -1.62
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.9□□□□□ -1.63
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