RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 SCGB1A1P11684 91 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-209ENST00000439106 OCR1Q9BZK8 76 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-209ENST00000439106 ATOX1O00244 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-209ENST00000439106 UQCRQO14949 82 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-209ENST00000439106 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-209ENST00000439106 CSAG1Q6PB30 78 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-209ENST00000439106 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-209ENST00000439106 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 H0Y9P7 68 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 MT1BP07438 61 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 SERP2Q8N6R1 65 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-209ENST00000439106 MP68P56378 58 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 KLKP1Q107X0 134 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 Q5VV11 94 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 LINC00208Q96KT6 92 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 H3BPC8 53 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 COX7CP15954 63 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-209ENST00000439106 A6NN06 94 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-209ENST00000439106 C20orf197Q8N268 126 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-209ENST00000439106 SNURFQ9Y675 71 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-209ENST00000439106 CCDC179H3BU77 68 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 NDUFC1O43677 76 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-5P60370 271 aa6.06□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.05□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 CRIPTQ9P021 101 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-209ENST00000439106 A8MUN3 132 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-209ENST00000439106 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-209ENST00000439106 H0YAA0 97 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-209ENST00000439106 NEBP20929 6669 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-209ENST00000439106 H7BZZ5 65 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-209ENST00000439106 PCP4P48539 62 aa5.95□□□□□ -1.46
PRAME-209ENST00000439106 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.94□□□□□ -1.46
PRAME-209ENST00000439106 DMAC1Q96GE9 116 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-209ENST00000439106 KMT2DO14686 5537 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-209ENST00000439106 H3BS24 57 aa5.9□□□□□ -1.46
PRAME-209ENST00000439106 P0C880 135 aa5.89□□□□□ -1.47
PRAME-209ENST00000439106 ACYP2P14621 99 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP5-9P26371 169 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 TMEM258P61165 79 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 MT1XP80297 61 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 R4GN34 69 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 MDN1Q9NU22 5596 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 M0QZ58 72 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 PLAC4Q8WY50 150 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-209ENST00000439106 COA5Q86WW8 74 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-209ENST00000439106 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-209ENST00000439106 LINC01554Q52M75 96 aa5.76□□□□□ -1.49
PRAME-209ENST00000439106 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.73□□□□□ -1.49
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRAME-209ENST00000439106 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-209ENST00000439106 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP12-2P59991 146 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 SPRR2EP22531 72 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 SPRR2BP35325 72 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 SPRR2AP35326 72 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PRAME-209ENST00000439106 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRAME-209ENST00000439106 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.53□□□□□ -1.52
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 SVIPQ8NHG7 77 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-12P60413 245 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 LCE3BQ5TA77 95 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-209ENST00000439106 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.46□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 SEC61GP60059 68 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GU69 56 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 SPRR2DP22532 72 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 Q1T7F1 81 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-209ENST00000439106 V9GYY9 64 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 PRR15LQ9BU68 103 aa5.38□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.36□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GU33 70 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.34□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.34□□□□□ -1.55
PRAME-209ENST00000439106 A0A0D9SG42 100 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-209ENST00000439106 PSPHP1O15172 72 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-209ENST00000439106 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.32□□□□□ -1.56
PRAME-209ENST00000439106 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-209ENST00000439106 UQCR11O14957 56 aa5.22□□□□□ -1.57
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP12-1P59990 96 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-209ENST00000439106 A8MU10 97 aa5.18□□□□□ -1.58
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