RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PP632Q6XCG6 107 aa5.93□□□□□ -1.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PKHD1P08F94 4074 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-8P60410 259 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RYR2Q92736 4967 aa5.84□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 P0C880 135 aa5.84□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YAA0 97 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 XP32Q5T750 250 aa5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RYR3Q15413 4870 aa5.8□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GVY2 172 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TPRXLQ17RH7 258 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-10P60014 251 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAT1Q14517 4588 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPG2P98160 4391 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-202ENST00000426333 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TNXBP22105 4242 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RYR1P21817 5038 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP12-2P59991 146 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.39□□□□□ -1.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP12-1P59990 96 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.36□□□□□ -1.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCBP2O75592 4640 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LPAP08519 4548 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HERC2O95714 4834 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-202ENST00000426333 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-202ENST00000426333 INE1O15225 51 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1HL1P0DM35 61 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP2P98164 4655 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HERC1Q15751 4861 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC17Q685J3 4493 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-12P60413 245 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC2Q02817 5179 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP12-3P60328 96 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE3AQ5TA76 89 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-202ENST00000426333 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.65□□□□□ -1.66
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF213Q63HN8 5207 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-5P60370 271 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE2CQ5TA81 110 aa4.4□□□□□ -1.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-202ENST00000426333 MT2AP02795 61 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1HP80294 61 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1FP04733 61 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
EFTUD2-202ENST00000426333 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-202ENST00000426333 USH2AO75445 5202 aa4□□□□□ -1.77
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP12-4P60329 112 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE3BQ5TA77 95 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1BP07438 61 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE2BO14633 110 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1XP80297 61 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 SSPOA2VEC9 5147 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2EP22531 72 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2BP35325 72 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2AP35326 72 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1GP13640 62 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms