RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 SPINK1P00995 79 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 Q8N1X5 172 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ROMO1P60602 79 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 TNXBP22105 4242 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 HERC2O95714 4834 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A1B0GU33 70 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-201ENST00000402521 C9orf92A6NGG3 77 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-201ENST00000402521 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-201ENST00000402521 K7ERS5 55 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-8P60410 259 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1HL1P0DM35 61 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-201ENST00000402521 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-201ENST00000402521 LPAP08519 4548 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-201ENST00000402521 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-201ENST00000402521 HERC1Q15751 4861 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-201ENST00000402521 P0C880 135 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-201ENST00000402521 LRP2P98164 4655 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-201ENST00000402521 J3QL48 77 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC2Q02817 5179 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-201ENST00000402521 TPRXLQ17RH7 258 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 XP32Q5T750 250 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 CRIPTQ9P021 101 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 S4R3F8 94 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF213Q63HN8 5207 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-201ENST00000402521 M0QZ58 72 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP12-1P59990 96 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-201ENST00000402521 NDUFAF8A1L188 74 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP12-2P59991 146 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A0D9SG42 100 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-201ENST00000402521 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC17Q685J3 4493 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-201ENST00000402521 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A0A0MQY5 61 aa4.4□□□□□ -1.7
EFTUD2-201ENST00000402521 PP632Q6XCG6 107 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-201ENST00000402521 PLAC4Q8WY50 150 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-201ENST00000402521 R4GN34 69 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-201ENST00000402521 LUZP6Q538Z0 58 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-201ENST00000402521 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE2CQ5TA81 110 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-201ENST00000402521 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-201ENST00000402521 M0R2T5 61 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1HP80294 61 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-201ENST00000402521 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-201ENST00000402521 TNP1P09430 55 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-201ENST00000402521 USH2AO75445 5202 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 MT2AP02795 61 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-10P60014 251 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1FP04733 61 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE2BO14633 110 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-201ENST00000402521 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-201ENST00000402521 INE1O15225 51 aa3.9□□□□□ -1.78
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-201ENST00000402521 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-201ENST00000402521 KMT2DO14686 5537 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1BP07438 61 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE3AQ5TA76 89 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-201ENST00000402521 SSPOA2VEC9 5147 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-5P60370 271 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-201ENST00000402521 MT1XP80297 61 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-12P60413 245 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP12-3P60328 96 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-201ENST00000402521 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-201ENST00000402521 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-201ENST00000402521 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.4 ms