RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 LINC01554Q52M75 96 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-201ENST00000398741 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-201ENST00000398741 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-8P60410 259 aa6.82□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 TNXBP22105 4242 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 H3BS24 57 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 HERC2O95714 4834 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 K7ERS5 55 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 XP32Q5T750 250 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 MYCBP2O75592 4640 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 S4R3F8 94 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-201ENST00000398741 MT1HL1P0DM35 61 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-201ENST00000398741 A0A0D9SG42 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-201ENST00000398741 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRAME-201ENST00000398741 ROMO1P60602 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PRAME-201ENST00000398741 CRIPTQ9P021 101 aa6.57□□□□□ -1.36
PRAME-201ENST00000398741 P0C880 135 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAME-201ENST00000398741 HERC1Q15751 4861 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-201ENST00000398741 TPRXLQ17RH7 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAME-201ENST00000398741 J3QL48 77 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAME-201ENST00000398741 LPAP08519 4548 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP12-2P59991 146 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAME-201ENST00000398741 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.41□□□□□ -1.38
PRAME-201ENST00000398741 LRP2P98164 4655 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-201ENST00000398741 M0QZ58 72 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP12-1P59990 96 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-201ENST00000398741 A0A0A0MQY5 61 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-201ENST00000398741 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-201ENST00000398741 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
PRAME-201ENST00000398741 R4GN34 69 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-201ENST00000398741 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-201ENST00000398741 MUC17Q685J3 4493 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-201ENST00000398741 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.13□□□□□ -1.43
PRAME-201ENST00000398741 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-201ENST00000398741 RNF213Q63HN8 5207 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-201ENST00000398741 MUC2Q02817 5179 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-201ENST00000398741 NDUFAF8A1L188 74 aa5.95□□□□□ -1.46
PRAME-201ENST00000398741 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.94□□□□□ -1.46
PRAME-201ENST00000398741 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRAME-201ENST00000398741 PP632Q6XCG6 107 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-201ENST00000398741 PLAC4Q8WY50 150 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-201ENST00000398741 LCE2CQ5TA81 110 aa5.74□□□□□ -1.49
PRAME-201ENST00000398741 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.73□□□□□ -1.49
PRAME-201ENST00000398741 TNP1P09430 55 aa5.71□□□□□ -1.49
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-201ENST00000398741 M0R2T5 61 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-201ENST00000398741 LUZP6Q538Z0 58 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-201ENST00000398741 MT1HP80294 61 aa5.6□□□□□ -1.51
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.59□□□□□ -1.52
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.54□□□□□ -1.52
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-10P60014 251 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-201ENST00000398741 MT2AP02795 61 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-201ENST00000398741 MT1FP04733 61 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-201ENST00000398741 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-201ENST00000398741 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-201ENST00000398741 LCE3AQ5TA76 89 aa5.38□□□□□ -1.55
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-201ENST00000398741 MT1BP07438 61 aa5.25□□□□□ -1.57
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-5P60370 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-201ENST00000398741 MT1XP80297 61 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.2□□□□□ -1.58
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-12P60413 245 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-201ENST00000398741 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP12-3P60328 96 aa5.12□□□□□ -1.59
PRAME-201ENST00000398741 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.09□□□□□ -1.59
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PRAME-201ENST00000398741 LCE2BO14633 110 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-201ENST00000398741 USH2AO75445 5202 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-201ENST00000398741 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PRAME-201ENST00000398741 SSPOA2VEC9 5147 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.89□□□□□ -1.63
PRAME-201ENST00000398741 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.82□□□□□ -1.64
PRAME-201ENST00000398741 INE1O15225 51 aa4.81□□□□□ -1.64
PRAME-201ENST00000398741 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.81□□□□□ -1.64
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-201ENST00000398741 KMT2DO14686 5537 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.76□□□□□ -1.65
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.76□□□□□ -1.65
PRAME-201ENST00000398741 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.74□□□□□ -1.65
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.65□□□□□ -1.67
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.6□□□□□ -1.67
PRAME-201ENST00000398741 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.57□□□□□ -1.68
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