RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ATOX1O00244 68 aa3.78□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 UQCRQO14949 82 aa3.78□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 MT2AP02795 61 aa3.78□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 Q5W150 140 aa3.78□□□□□ -1.8
SGMS1-201ENST00000361543 SSPOA2VEC9 5147 aa3.77□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.77□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 IMUPQ9GZP8 106 aa3.77□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.76□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 MT1FP04733 61 aa3.75□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB1A1P11684 91 aa3.74□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WVE0 104 aa3.73□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 MP68P56378 58 aa3.73□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-10P60014 251 aa3.73□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.72□□□□□ -1.81
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y9P7 68 aa3.71□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.71□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 H3BPC8 53 aa3.7□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf47Q569G3 176 aa3.7□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.7□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ATP8P03928 68 aa3.69□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 OCR1Q9BZK8 76 aa3.69□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf26Q17RF5 130 aa3.68□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.68□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00208Q96KT6 92 aa3.66□□□□□ -1.82
SGMS1-201ENST00000361543 A8MUN3 132 aa3.65□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.64□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.64□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.63□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 S4R3F8 94 aa3.63□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 CSAG1Q6PB30 78 aa3.61□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 PRAC1Q96KF2 57 aa3.6□□□□□ -1.83
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFC1O43677 76 aa3.56□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 KLKP1Q107X0 134 aa3.56□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.56□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 LCA10Q71F78 164 aa3.56□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 SERP2Q8N6R1 65 aa3.56□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 DMAC1Q96GE9 116 aa3.54□□□□□ -1.84
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.52□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 NEBP20929 6669 aa3.51□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 ACYP2P14621 99 aa3.51□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf197Q8N268 126 aa3.51□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.5□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.5□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 H0YAA0 97 aa3.49□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 SNURFQ9Y675 71 aa3.49□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 COX7CP15954 63 aa3.48□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 CRIPTQ9P021 101 aa3.48□□□□□ -1.85
SGMS1-201ENST00000361543 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.46□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.45□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.45□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 Q5VV11 94 aa3.44□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 MT1BP07438 61 aa3.43□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.43□□□□□ -1.86
SGMS1-201ENST00000361543 A6NN06 94 aa3.4□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.4□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.4□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF8A1L188 74 aa3.38□□□□□ -1.87
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC179H3BU77 68 aa3.36□□□□□ -1.87
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SGMS1-201ENST00000361543 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.36□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 COA5Q86WW8 74 aa3.35□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 R4GN34 69 aa3.35□□□□□ -1.87
SGMS1-201ENST00000361543 SEC61GP60059 68 aa3.33□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 MDN1Q9NU22 5596 aa3.31□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 M0QZ58 72 aa3.3□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 P0C880 135 aa3.3□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.3□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM258P61165 79 aa3.29□□□□□ -1.88
SGMS1-201ENST00000361543 KMT2DO14686 5537 aa3.28□□□□□ -1.88
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SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.24□□□□□ -1.89
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.24□□□□□ -1.89
SGMS1-201ENST00000361543 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.24□□□□□ -1.89
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-9P26371 169 aa3.23□□□□□ -1.89
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SGMS1-201ENST00000361543 PRR15LQ9BU68 103 aa3.23□□□□□ -1.89
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SGMS1-201ENST00000361543 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.15□□□□□ -1.91
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SGMS1-201ENST00000361543 V9GYY9 64 aa3.14□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.13□□□□□ -1.91
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.13□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.12□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR2EP22531 72 aa3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR2BP35325 72 aa3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR2AP35326 72 aa3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.11□□□□□ -1.91
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