RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 A8MTW9 85 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DEFB131AP59861 70 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DEFB130BP0DP73 79 aa3.38□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DEFB130AP0DP74 79 aa3.38□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.38□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 APLNQ9ULZ1 77 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GVY2 172 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 PKD1P98161 4303 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DEFB4AO15263 64 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 DEFB1P60022 68 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-202ENST00000327307 HSPG2P98160 4391 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 HERC1Q15751 4861 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.27□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 HTN3P15516 51 aa3.26□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 LCE1DQ5T752 114 aa3.26□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.25□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.25□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 HTN1P15515 57 aa3.24□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 MYCBP2O75592 4640 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 FAT1Q14517 4588 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-202ENST00000327307 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 H3BNG1 76 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.19□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 PRLHP81277 87 aa3.19□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 SPRR1AP35321 89 aa3.18□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 Q5VSD8 79 aa3.17□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 A0A096LPF7 62 aa3.15□□□□□ -1.9
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-1P60331 282 aa3.14□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.14□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 PRO0255Q9UI72 69 aa3.14□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.12□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.11□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 S4R3F8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
RRN3-202ENST00000327307 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.09□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 SPRR1BP22528 89 aa3.08□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.07□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 SPINK1P00995 79 aa3.07□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.03□□□□□ -1.92
RRN3-202ENST00000327307 RNF213Q63HN8 5207 aa3.03□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 MT3P25713 68 aa3.02□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 LRP2P98164 4655 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 LCE1FQ5T754 118 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 TNXBP22105 4242 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 MT1HL1P0DM35 61 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-202ENST00000327307 A0A0D9SG42 100 aa2.93□□□□□ -1.94
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP12-1P59990 96 aa2.93□□□□□ -1.94
RRN3-202ENST00000327307 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.89□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.88□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 A0A096LNI7 61 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 LPAP08519 4548 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 MUC2Q02817 5179 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.85□□□□□ -1.95
RRN3-202ENST00000327307 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.81□□□□□ -1.96
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-10P60014 251 aa2.81□□□□□ -1.96
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.77□□□□□ -1.97
RRN3-202ENST00000327307 LCE1EQ5T753 118 aa2.77□□□□□ -1.97
RRN3-202ENST00000327307 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.76□□□□□ -1.97
RRN3-202ENST00000327307 LCE4AQ5TA78 99 aa2.75□□□□□ -1.97
RRN3-202ENST00000327307 M0QZ58 72 aa2.7□□□□□ -1.98
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.7□□□□□ -1.98
RRN3-202ENST00000327307 MUC17Q685J3 4493 aa2.7□□□□□ -1.98
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP12-4P60329 112 aa2.69□□□□□ -1.98
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.65□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.65□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-12P60413 245 aa2.64□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.63□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.61□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.59□□□□□ -1.99
RRN3-202ENST00000327307 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RRN3-202ENST00000327307 MT1HP80294 61 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms