RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa11.38□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem52Q9D702 196 aa11.38□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav2Q5R1I9 109 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1199Q8VF94 310 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr365Q8VFT2 312 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd3eP22646 189 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr761Q7TRJ0 323 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P04219 140 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp248Q640N4 576 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf185Q91YT2 192 aa11.37□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ep300B2RWS6 2412 aa11.36□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa11.36□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa11.36□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RhohQ9D3G9 191 aa11.36□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vsig8Q6P3A4 417 aa11.35□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01756 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01757 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2cQ9D1C1 179 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igsf23B2RTN2 239 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccl17F6R5P4 103 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Borcs7Q9CRC6 105 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col6a4A2AX52 2309 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm6904E9PVF1 202 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r1E9PVR6 306 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01736 120 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igll1P20764 209 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccl21aP84444 133 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccl21bP86792 133 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccl21cP86793 133 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm15294V9GXA7 121 aa11.34□□□□□ -0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tstd1E9PY03 133 aa11.33□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01791 123 aa11.33□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srsf12Q8C8K3 266 aa11.33□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2l6Q9QZU9 153 aa11.33□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Omt2bD3YX29 119 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav3-3Q5R1C3 114 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Med13lQ6JPI3 2207 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sdk1Q3UH53 2193 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv8-6A0A0A6YXA3 118 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cend1Q9JKC6 149 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm13030A2APQ6 143 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10521E9PZK0 135 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm28051J3QMA2 81 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nutf2P61971 127 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spock3Q8BKV0 436 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nit2Q9JHW2 276 aa11.32□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nbeal1E9PYP2 2688 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2-DMb1P35737 261 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bsph1Q3UW26 133 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prickle3Q80VL3 624 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r216Q8R257 298 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2-DMb2Q31099 261 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tctex1d4Q8CDY7 219 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa11.31□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lcn2P11672 200 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SnrpcQ62241 159 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NpbQ8K4P1 119 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fmc1Q9CR13 113 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9D131 166 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1245A0A1L1SQJ6 307 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm1968Q3T9I3 115 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OtoglF7A4A7 2325 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-16A0A075B5U1 98 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm28038F7BCN9 126 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cited2O35740 269 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-62-3P01754 117 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q4KKZ1 196 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ang5Q5GAN1 145 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Odf3Q920N1 254 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klf13Q9JJZ6 289 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Npc2Q9Z0J0 149 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20458E9PXJ7 78 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21994F6T2D2 329 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr311Q5NC59 308 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1437Q7TQR7 312 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klhdc1Q80YG3 406 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9961Q8BNV2 113 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl20Q9CQL4 149 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psmb2Q9R1P3 201 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.9 ms