RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NECAP1-222	ENST00000640072	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.34	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.34	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	CUBN	O60494	3623 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	CENPE	Q02224	2701 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BNG1	76 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.25	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.24	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	ATR	Q13535	2644 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	INE1	O15225	51 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NECAP1-222	ENST00000640072	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072		S4R3F8	94 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	LCE2B	O14633	110 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	FBN2	P35556	2912 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	LCE2C	Q5TA81	110 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NECAP1-222	ENST00000640072	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	PDZD2	O15018	2839 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	XP32	Q5T750	250 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	TG	P01266	2768 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	3.1	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NECAP1-222	ENST00000640072	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.09	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	ANK2	Q01484	3957 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072		J3QKU1	62 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	C9orf92	A6NGG3	77 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	FLNC	Q14315	2725 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	VWF	P04275	2813 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	STAB1	Q9NY15	2570 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NECAP1-222	ENST00000640072	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	MAST4	O15021	2626 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072		M0QZ58	72 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	ITPR3	Q14573	2671 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	TENM3	Q9P273	2699 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
NECAP1-222	ENST00000640072	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		2.89	□□□□□ -1.95
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP10-11	P60412	298 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NECAP1-222	ENST00000640072	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NECAP1-222	ENST00000640072	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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