RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf87E5RJ46 101 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TRACP01848 142 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CCKP06307 115 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CEND1Q8N111 149 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GVX0 72 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MWP4 228 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BQ85 93 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAL4O96015 105 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 SPINK7P58062 85 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 FXYD2P54710 66 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA45Q537H7 98 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 SVIPQ8NHG7 77 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.92□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2V1Q13404 147 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMB2P49721 201 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS25Q9BRG1 176 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 VAMP8Q9BV40 100 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 J3KT08 172 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 COX6CP09669 75 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 K7ERJ3 54 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DSCR8Q96T75 97 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFB1O75438 58 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD52Q0P140 79 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZQT0 140 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NEBP20929 6669 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 C9JAW5 83 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM6P0DI80 62 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZVQ6 151 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GW54 56 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR15Q8IV56 129 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PYY3Q5JQD4 70 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NN06 94 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE6GP18545 87 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 hDV103S1A0JD37 113 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFS5O43920 106 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV2-30P06310 120 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 NREPQ16612 68 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1BP07438 61 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 ATXN8Q156A1 80 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf118A6NHY6 69 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EQZ3 153 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 Q5W150 140 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf26Q17RF5 130 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 Q5VV11 94 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GV90 55 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 C5orf47Q569G3 176 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 TSTD3H0UI37 97 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-5P60370 271 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 MDN1Q9NU22 5596 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-9P26371 169 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 KMT2DO14686 5537 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE4AQ5TA78 99 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 HCG22E2RYF7 251 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 BPY2O14599 106 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE3BQ5TA77 95 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R143 59 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 CASC2Q6XLA1 102 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 S4R3F8 94 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 CSAG1Q6PB30 78 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCL6P80162 114 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 LCA10Q71F78 164 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 Q8N9L7 120 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-226ENST00000593200 KLKP1Q107X0 134 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms