RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 Q8NBF4 154 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 NREPQ16612 68 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 CXCL6P80162 114 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1W2PNM2 257 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 IGFL1Q6UW32 110 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 SSPOA2VEC9 5147 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 BPY2O14599 106 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 ATOX1O00244 68 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 USH2AO75445 5202 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 M0R2T5 61 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 MOBPQ13875 183 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 A0A087WSZ3 146 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 A0A087WVE0 104 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 XP32Q5T750 250 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 J3KT08 172 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 SPINK1P00995 79 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0G2JQZ4 141 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 PCOTHQ58A44 107 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV4-1P06312 121 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 CD164Q04900 197 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 UQCRQO14949 82 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 SERP2Q8N6R1 65 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 COX7CP15954 63 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFB1O75438 58 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 DSCR10P59022 87 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 Q8N9L7 120 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 Q5XG85 94 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 A8MWP4 228 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 K7EQZ3 153 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 HCG22E2RYF7 251 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 CCDC179H3BU77 68 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 LIMD2Q9BT23 127 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 PRR15Q8IV56 129 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf92A6NGG3 77 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 CASC2Q6XLA1 102 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 Q96NJ1 140 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1B0GVX0 72 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 OCR1Q9BZK8 76 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR2E-210ENST00000592597 C1orf195Q5TG92 126 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 C20orf197Q8N268 126 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 hDV103S1A0JD37 113 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFC1O43677 76 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 C8orf87E5RJ46 101 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 C5orf47Q569G3 176 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR2E-210ENST00000592597 KLKP1Q107X0 134 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 MP68P56378 58 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM258P61165 79 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 H3BPC8 53 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR2E-210ENST00000592597 SNURFQ9Y675 71 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFS5O43920 106 aa8□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00313P59037 77 aa8□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 LCE2BO14633 110 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 H0Y9P7 68 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 H7BZZ5 65 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236CP0DP71 79 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00208Q96KT6 92 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 MT2AP02795 61 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175.3 ms