RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 Q8NBF4 154 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 NREPQ16612 68 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 CXCL6P80162 114 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1W2PNM2 257 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 IGFL1Q6UW32 110 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR2E-210ENST00000592597 SSPOA2VEC9 5147 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 BPY2O14599 106 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 ATOX1O00244 68 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR2E-210ENST00000592597 USH2AO75445 5202 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.44□□□□□ -1.06
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POLR2E-210ENST00000592597 MOBPQ13875 183 aa8.44□□□□□ -1.06
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POLR2E-210ENST00000592597 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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POLR2E-210ENST00000592597 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 A0A087WVE0 104 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 XP32Q5T750 250 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR2E-210ENST00000592597 J3KT08 172 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 SPINK1P00995 79 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0G2JQZ4 141 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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POLR2E-210ENST00000592597 CD164Q04900 197 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR2E-210ENST00000592597 UQCRQO14949 82 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 SERP2Q8N6R1 65 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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POLR2E-210ENST00000592597 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 Q8N9L7 120 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 Q5XG85 94 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR2E-210ENST00000592597 A8MWP4 228 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR2E-210ENST00000592597 K7EQZ3 153 aa8.26□□□□□ -1.09
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POLR2E-210ENST00000592597 FAM236CP0DP71 79 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00208Q96KT6 92 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
POLR2E-210ENST00000592597 MT2AP02795 61 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.89□□□□□ -1.15
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POLR2E-210ENST00000592597 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR2E-210ENST00000592597 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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