RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 Q96NJ1 140 aa13.1□□□□□ -0.31
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCBP2O75592 4640 aa13.08□□□□□ -0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GVX0 72 aa13.05□□□□□ -0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 FAT1Q14517 4588 aa13.03□□□□□ -0.32
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf87E5RJ46 101 aa13.02□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf195Q5TG92 126 aa13.01□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 CASC2Q6XLA1 102 aa13.01□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.99□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 SERP2Q8N6R1 65 aa12.99□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.98□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 J3QL48 77 aa12.96□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf17Q9NRJ1 99 aa12.96□□□□□ -0.33
CAPNS1-212ENST00000591041 hDV103S1A0JD37 113 aa12.95□□□□□ -0.34
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CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-8P60410 259 aa12.93□□□□□ -0.34
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CAPNS1-212ENST00000591041 COX7CP15954 63 aa12.92□□□□□ -0.34
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa12.91□□□□□ -0.34
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CAPNS1-212ENST00000591041 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa12.86□□□□□ -0.35
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf47Q569G3 176 aa12.79□□□□□ -0.36
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CAPNS1-212ENST00000591041 UBR4Q5T4S7 5183 aa12.67□□□□□ -0.38
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CAPNS1-212ENST00000591041 H0Y9P7 68 aa12.62□□□□□ -0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KLKP1Q107X0 134 aa12.62□□□□□ -0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RETNLBQ9BQ08 111 aa12.61□□□□□ -0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 HMCN2Q8NDA2 5059 aa12.59□□□□□ -0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa12.55□□□□□ -0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa12.54□□□□□ -0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00208Q96KT6 92 aa12.52□□□□□ -0.41
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CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf64Q8NEQ6 169 aa12.5□□□□□ -0.41
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CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf92A6NGG3 77 aa12.49□□□□□ -0.41
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CAPNS1-212ENST00000591041 Q5W150 140 aa12.33□□□□□ -0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TPRXLQ17RH7 258 aa12.32□□□□□ -0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa12.31□□□□□ -0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.3□□□□□ -0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM236CP0DP71 79 aa12.3□□□□□ -0.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.29□□□□□ -0.44
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CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa12.26□□□□□ -0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa12.25□□□□□ -0.45
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CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf65Q6ZTY9 151 aa12.24□□□□□ -0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 XP32Q5T750 250 aa12.22□□□□□ -0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP2P98164 4655 aa12.21□□□□□ -0.45
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CAPNS1-212ENST00000591041 A8MUN3 132 aa11.95□□□□□ -0.5
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CAPNS1-212ENST00000591041 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.81□□□□□ -0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 C4orf26Q17RF5 130 aa11.81□□□□□ -0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 COA5Q86WW8 74 aa11.81□□□□□ -0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.78□□□□□ -0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 COX6B2Q6YFQ2 88 aa11.77□□□□□ -0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.75□□□□□ -0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 LPAP08519 4548 aa11.73□□□□□ -0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.71□□□□□ -0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 V9GYY9 64 aa11.66□□□□□ -0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC2Q02817 5179 aa11.57□□□□□ -0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.52□□□□□ -0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.52□□□□□ -0.57
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